拟南芥和水稻基因组中PLD家族分析

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磷脂酶D(phospholipaseD,简称PLD)即磷脂酰胆碱磷脂水解酶,属催化磷酸二酯键水解和碱基交换的一类酶的总称。是植物组织中普遍存在的一种酶。PLD及其产物PA在信号传导、膜脂降解中起重要作用,与植物胁迫密切相关。本研究中用两种方法检索了模式植物拟南芥和水稻的基因组,获得编码含有PLD的基因。一是以已知PLD基因的序列作为检索条件,利用BLAST查找其同源序列。二是根据PLD基因的保守氨基酸序列编写正则表达式,用Perl语言操纵含有基因组数据的本地Mysql数据库。这两种方法得
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