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目的:利用微阵列基因芯片技术检测前列腺癌(PCa)、前列腺增生性炎性萎缩(PIA)和癌旁非癌组织中差异表达的m RNA和lnc RNA。观察前列腺恶性转化过程中基因表达的动态变化,进而发现可能存在的前列腺非可控性炎症至恶性癌变过程中的特征分子网络,为PIA→PCa发病模式提供分子层面的新证据,以期为临床前列腺癌的预防、诊疗,以及发病机制提供新理论及新方案。方法:收集2013年8月至2014年8月我院前列腺切除术后临床组织标本共20例,通过改进标本获取方式,运输途径,破碎方法三方面因素,建立从离体组织标本提取高质量总RNA的方法。随后在此方法基础上,通过冰冻切片结合手工显微切割技术在同一前列腺组织标本中分离出PCa、PIA及癌旁非癌组织各区域的纯净细胞群。采用lnc RNA+m RNA表达谱芯片分析三者间的基因表达差异(生物学重复3次),通过生物信息学的方法筛选出具有显著表达差异的m RNA和lnc RNA,并对结果进行Pathway分析等初步的生物信息学分析,反向Cis-预测lnc RNA的靶基因,在发生显著变化的炎症和/或癌症通路上建立lnc RNA与靶基因的基因网络图。结果:1.前列腺癌根治术后获取的离体组织标本,在30min内放入液氮冻存,经液氮研磨或冰冻切片均可以提取到高质量的总RNA(RIN>7.5)。2.手工显微切割获取的组织,可通过Trizol法提取到满足高通量微阵列技术要求的高质量RNA,但H&E染色会降低RNA的完整性。3.基因表达谱芯片的结果显示:人前列腺癌组织与癌旁非癌组织对照相比,有2610个m RNA表达有差异,其中上调689个,下调1921个;同时有2176个lnc RNA表达有差异,其中上调688个,下调1488个。人前列腺增生性炎性萎缩组织与癌旁非癌组织相比,有592个m RNA表达有差异,其中上调183个,下调409个;同时有575个lnc RNA表达有差异,其中上调160个,下调415个。人前列腺癌组织与前列腺增生性炎性萎缩组织相比,有1007个m RNA表达有差异,其中上调115个,下调892个;有773个lnc RNA表达有差异,其中上调105个,下调668个。在3种组织类型的共同比较中,有113个m RNA的表达存在显著线性差异,其中上调8个,下调105个;有106个lnc RNA的表达也存在显著线性差异,其中上调11个,下调95个。4.Pathway分析显示,差异基因显著富集在了22条信号通路上,其中有9条通路与炎症和/或癌症密切相关,这些通路在疾病的进展中发生了显著的变化。结论:1.冰冻切片并H&E染色结合“排除法”手工显微切割技术,可经济、有效地鉴定分离出目的细胞亚群,且通过Trizol法提取的总RNA能够满足高通量微阵列技术的质量要求。2.基因表达谱芯片是一种高通量筛选m RNA和lnc RNA表达差异的理想的技术手段。3.人前列腺癌组织,前列腺增生性炎性萎缩组织与癌旁非癌组织,三者在基因表达层面均存在显著差异。众多的差异分子发生交互作用,并与多种炎症和/或癌症相关的信号转导通路紧密相连,预示着lnc RNA很可能在非可控性炎症介导的恶性转化中起着重要作用。lnc RNA可能成为前列腺癌全新的肿瘤标记物和潜在的治疗靶点。