全面预算管理是一种集系统化、战略化和人本化理念为一体的现代管理模式,它是对单位内部各种财务及非财务资源进行有效地分配、控制,组织、和协调单位内部生产经营活动,是完成既定的目标的管理工具。全面预算管理是由一系列预算所构成的预算管理体系,是企业综合的、全面的管理,是具有全面控制约束力的一种管理机制。随着世界范围内科技的蓬勃发展和国际间科技竞争的加剧,科技活动越来越受到各国政府的重视。科技活动范围不断扩大、内容不断增多,科技投入资金也大幅度增加,科研院所的科研项目经费成为国家财政支出的重要组成部分。然而,我国引入全面预算管理体系主要集中于企业,很少涉足到事业单位,对于在科研院所的应用研究更是少之又少,国内对于科研院所科研项目的有效管理成为一个盲区。如果能将全面预算理论应用于科研项目的管理中,必将增强国家科研经费的使用效益,规避风险。本文将首先介绍全面预算管理的理论体系,接着通过对国内外预算管理现状进行深入细致的调研,指出其存在的问题,并提出可以利用全面预算管理的模式和方法来解决。然后,以科研院所为例,借鉴全面预算管理理论研究,进行全面预算管理框架和体系设计。最后,重申可以在科研院所科研项目实行全面预算管理的观点,但在具体实施过程中还有一些难点需要解决。本文的研究对加强科研院所科研项目的预算管理工作,提高科研项目经费管理水平具有重要的现实意义。