生物多样性是人类赖以生存和发展的基础。随着生物多样性保护形势的日益严峻,重庆市各级政府及人民对生物多样性相关问题的认识逐渐加深,对生物多样性保护的资金投入也在不断增加。但在保持资金投入持续增长的同时,如何稳定提高生物多样性保护资金投入产出效率,已成为当前我市亟需解决的重要问题。因此,通过对我市生物多样性保护资金投入产出效率进行系统、全面的评价及分析,找出其投入产出效率具有的优势和存在的问题,对重庆市整体推进生物多样性保护工作具有重要的现实意义。本文首先基于生物多样性保护资金投入产出效率评价理论、国内外投入产出效率相关研究理论和相关方法的综述,明确了生物多样性、生物多样性保护以及生物多样性保护投入产出效率的涵义和研究口径,同时介绍了DEA方法以及聚类分析方法的基本理论,为以后构建生物多样性保护投入产出效率的评价指标体系奠定了基础;其次依据DEA方法,建立了由4个决策单元、15个评价指标组成的投入产出效率评价指标体系,然后依据相关统计资料,对2006年至2009年重庆市生物多样性保护资金投入产出整体效率的技术有效性、规模有效性进行了测度,对规模、效益之间的关系以及投入产出无效的原因进行了剖析,指出了制约投入产出效率提升的主要因素;第三根据聚类分析方法,建立起重庆市生物多样性保护直接产出和重庆市生物多样性保护经济价值产出两个特定组合的DEA效率测度模型,从不同角度考察我市的生物多样性保护投入产出效率,从而分析各类指标在生物多样性保护投入产出中的优势和劣势以及投入产出无效的原因剖析,指出了制约投入产出效率提升的主要因素;最后针对我市生物多样性保护资金投入产出效率存在的问题提出了提升我市生物多样性保护资金投入产出效率的资金投入原则、资金投入政策以及政策保障。