本文在系统总结现行农业科研事业单位财务会计制度特点的基础上,剖析了农业科研事业单位在会计制度和财务管理方面存在的一些问题,提出了完善农业科研事业单位财务会计制度的建议。农业科研单位作为社会公益性的事业单位,随着国家对其投入的加大和财政管理体制改革步伐的加快,现行的农业事业单位会计制度面临着诸多挑战,需要进一步改革和创新,因此加强对农业科研事业单位的财务管理和会计核算,归集现行农业事业单位会计制度存在的问题,并提出相关解决措施,是会计学的热点研究内容之一。本文首先系统总结了农业科研的主要特征,进而分析得出农业科研事业单位财务会计制度的特点,并通过对湖南省农业科学院的案例分析,剖析了农业科研事业单位在会计制度和财务管理方面存在的问题。然后以行政事业单位收支分类改革为契机,针对农业科研单位的行业特点并结合典型案例,适当借鉴了西方非营利组织的核算方法,从引入权责发生制、重新划分会计要素、改进会计核算体系、建立完善的会计报表体系、注重加强对资产和经费的管理等5个方面对我国农业科研事业单位的会计制度改革作了进一步的探讨并提出了相关建议。