本研究以江苏地区不同群体日本沼虾(Macrobrachium nipponense)为研究对象,通过研究其系统发生关系、肌肉营养品质、遗传多样性和亲缘关系,从而评价其遗传现状,为日本沼虾的遗传育种和进一步深入研究提供理论依据。试验一用16S rDNA序列探讨长臂虾亚科部分种属的系统发育关系本研究获得了长臂虾亚科、沼虾属、日本沼虾(M.nipponense)线粒体基因16SrDNA部分序列,与GenBank中的相关4属9个种的16s rDNA序列进行同源性比对,探讨其系统发育关系。结果显示,在长为442 bp的16s rDNA序列中,变异位点188个,简约信息位点125个,碱基转换与颠换值比为1.134。以鼓虾(Alpheus cylindricus)为外群,分别用MP法、NJ法及ML法构建的长臂虾亚科4属的系统发育关系分支图表明:白虾属首先与长臂虾属以及小长臂虾属聚在一起,然后与沼虾属聚为一支;长臂虾属(Palaemon)和小长臂虾属(Palaemonetes)出现四个种混合相聚的现象,表明这两个近缘属在形态学上以大颚有无触须作为属级鉴定特征的鉴定方法尚需进一步审定;属间结点置信值以及聚集情况稳定,表明16S rDNA序列可作为推断属间关系的有效遗传标记。试验二江苏地区十个日本沼虾群体遗传多样性和亲缘关系的RAPD分析用RAPD技术研究了江苏地区10个日本沼虾(M.nipponense)群体的遗传多样性和亲缘关系。以40个10碱基随机引物对其基因组DNA进行扩增,选取其中18个扩增产物多态性好的引物进行分析。结果共扩增出234个DNA片段,大小在250～2000bp之间,其中126个位点表现为多态位点,多态位点比例为53.85%。常州滆湖繁保区的日本沼虾的遗传多样性最高,遗传多样性指数为0.1742,宿迁骆马湖池塘养殖日本沼虾的遗传多样性最低,遗传多样性指数为0.1263。UPGMA聚类分析表明,常州涌湖繁保区和苏州太湖胥口镇渔洋山西南侧水域的亲缘关系最近,总体上亲缘关系和地理位置呈正相关。试验三江苏地区四个日本沼虾群体肌肉营养品质的比较本研究比较了江苏4个野生和养殖群体的日本沼虾(M.nipponense)的肌肉营养品质。4个群体日本沼虾分别于2006年10月采集于苏州太湖叶山岛北侧湖区(TH)、苏州浦庄新南渔场(PZ)、长江江心洲江段(CJ)和南京浦口养殖场(PK)。肌肉营养成分检测表明,PK群体的粗蛋白、粗脂肪最高((21.237±1.015)%、(1.652±0.087)%,P＜0.05)。PK群体的EAA、DAA最高((11.1595±1.3075)%、(9.0215±1.7260)%,P＞0.05),但其差异不显著。而CJ群体和PK群体的MUFA(23.85%、28.65%)和PUFA(7.52%、8.06%)较其他群体高;另外CJ群体和PK群体的必需氨基酸指数(EAAI)也最为接近理想蛋白(70.92、79.63),说明CJ群体和PK群体日本沼虾的肌肉组成更为合理。研究结果表明几个群体肌肉营养品质存在一定的差异。试验四日本沼虾肌肉营养指标和遗传特性的相关性分析本研究分析了4个群体日本沼虾(M.nipponense)肌肉营养指标与遗传特性的相关性,使用遗传多样系数(Ne)、Shannon指数、粗脂肪、粗蛋白、微量元素、必需氨基酸含量、必需氨基酸指数(EAAI)、不饱和脂肪酸(UFA)含量作为参数进行分析,结果表明日本沼虾的种质、生长环境、饲料营养等因素共同作用于肌肉品质,两者之间并没有单一的相关性。