定远猪三个品系遗传结构RAPD分析

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淮猪是我国重要的地方猪种资源,分布于淮河流域,是品种选育和新品种培育的重要素材。近些年来围绕淮猪品系选育取得重要进展,其中在肉质、多产性和抗逆性分别建立了D1系、DY系和DH系种群,并在猪业生产中示范推广和应用。为了充分了解3个品系种群的遗传结构,认识其性能分化的遗传基础,为品系繁育工作的进一步开展,本研究分别统计了淮猪D1、DY和DH品系培育群的窝产仔数;屠宰测定3个品系选育群淘汰猪肥育的肉质性状(各8头);再选育群抽测30头种猪,采集其毛囊组织,提取DNA样本;随机选取16条10个碱基的随机引物进行RAPD扩增,然后运用Popgen1 32软件对其进行种群遗传结构和遗传距离分析。结果显示:(1)D1系的失水率、白度、嫩度显著低于DY和DH系(P<0.05),并且蛋白质含量、粗脂肪含量和熟肉率较高(P<0.05),肉品较好。DY和DH系除了白度指标有差别外,其他指标之间无明显差异(P>0.05)。(2)8条随机引物扩增出38个扩增片段,共计485个条带,所获得的条带标记数在3~7之间,多态标记数在3~6之间,标记分子量大小范围为0.25~2kb;在所有多态条带中,D1出现18条占47.37%,DY中出现13条占34.21%,DH出现13条,点34.21%,显示明显的遗传差异。(3)遗传距离分析表明,D1与DY的遗传距离为0.3507,DY与DH的遗传距离为0.0523,D1与DH之间的遗传距离为0.3821;DY与DH的遗传距离较近,它们分别与D1的遗传距离偏远;RAPD聚类结果与依据肉质指标的聚类结果一致。(4)通过对特异片段进行测序和GenBank-BLAST,解析其中7个特异片段,分别来自X、7、13、14和18号染色体。
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