儿童急性淋巴细胞白血病关联基因的SNP风险预测

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hualidewushi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)是儿童期最常见的恶性肿瘤,多发于2-5岁幼儿。虽然ALL的病因及发病机制仍不明确,但多认为是受遗传因素和环境因素的共同影响。我们通过文献筛选出与欧洲儿童ALL有关联性的 7 个基因(ARID5B,CDKN2A,CEBPE,IKZF1,INTS10,OR8U8,TP63),并探讨这7个基因的8个单核苷酸多态性位点(ARID5B基因rs7089424和rs10994982、CDKN2A 基因 rs3731217、CEBPE 基因 rs4982731、IKZF1 基因rs11978267、INTS10 基因 rs920590、OR8U8 基因 rs1945213、TP63 基因 rs17505102)与中国汉族儿童ALL的关联性,从而有助于进一步阐明ALL的发病机制。方法:收集我院2015年6月-2015年12月期间入院的190例ALL患儿的血标本,提取DNA,并采用PCR结合质谱方法检测7个基因(ARID5B、IKZF1、CEBPE、CDKN2A、TP63、OR8U8、INTS10)的 8 个单核苷酸多态性位点(rs10994982,rs7089424,rs3731217,rs4982731,rs11978267,rs920590,rs1945213,rs17505102),并以270例非ALL儿童为对照组。之后应用统计学分析这8个单核苷酸多态性位点与儿童ALL相关性以及同一基因不同基因型与儿童ALL易感性的关系。结果:190例ALL患儿中,3-6岁患儿70例(约占36.8%),其中儿童ALL的两大主要遗传学分型-超二倍体(染色体数目>50条)和TEL/AML融合基因,其检出率分别为18.4%和17.9%。对病例组和正常对照组的8个单核苷酸多态性位点的基因频率及基因型进行统计学分析,发现ARID5B基因rs10994982 A风险等位基因和rs7089424 G风险等位基因在病例组和正常对照组之间分布具有统计学差异(rs10994982,P=0.003;rs7089424,P=0.001);ARID5B 基因 rs10994982 的基因型AG、AA、GG以及ARID5B基因rs7089424的基因型TT、GG、GT在病例组和正常对照组中的分布具有统计学差异(rs10994982,P=0.0014;rs7089424,P=0.0071)。对这8个单核苷酸多态性位点与ALL的临床危险度、免疫分型以及细胞遗传学分型进行统计学分析发现,ARID5B基因rs10994982的AA基因型和rs7089424的GT/GG基因型与中国儿童中危组和低危组的ALL有显著关联性(rs10994982 中危组 OR=2.437,95%CI=1.168-5.085,低危组 OR=3.550,95%CI=1.501-8.397;rs7089424 中危组 OR=1.969,95%CI=1.110-3.495,低危组OR=2.157,95%CI=1.130-4.115),而与高危组没有关联性。ARID5B 基因 rs10994982 AG/AA基因型和rs7089424GT/GG基因型与儿童B系淋巴细胞白血病(B-ALL)有关联性,而与儿童T系淋巴细胞白血病(T-ALL)没有显著关联(rs 10994982 B-ALL OR=1.724,95%CI=1.070-2.780,T-ALL OR=1.427,95%CI=0.391-5.204;rs7089424 B-ALL OR=1.841,95%CI= 1.215-2.790,T-ALL OR=0.985,95%CI=0.341-2.846)。ARID5B 基因 rs7089424 的 G 风险等位基因与儿童 B-ALL超二倍体的发病风险有显著相关性(P<0.05),ARID5B基因rs10994982的A风险等位基因与儿童ALL的细胞遗传学分型并无明显的相关性。CDKN2A基因rs3731217、CEBPE 基因 rs4982731、IKZF1 基因 rs11978267、INTS10 基因 rs920590、OR8U8基因rs1945213和TP63基因rs17505102各自的风险等位基因频率和基因型频率在两组之间的分布结果均无统计学差异。结论:1、ARID5B基因的单核苷酸多态性位点rs7089424和rs10994982与儿童ALL易感性有关,同时也与儿童ALL临床危险度分型中的低危组和中危组相关,进一步分析发现这两个位点都与儿童B-ALL相关,而与T-ALL没有关联性。2、未发现 CDKN2A 基因 rs3731217、CEBPE 基因 rs4982731、IKZF1 基因rs11978267、INTS10 基因 rs920590、OR8U8 基因 rs1945213、TP63 基因 rs17505102单核苷酸多态性位点与中国儿童ALL有关联性。
其他文献
血小板主要用于预防和治疗血小板减少及其功能障碍引起的出血和出血倾向,在临床发挥着不可替代的作用。血小板主要来源于无偿献血者,尽管按照国家规定对其进行检测,但仍存在
肿瘤是由一群异质性的细胞组成的,这些细胞处于不同的分化阶段,其中有一小部分细胞在肿瘤形成中发挥重要作用,这群细胞被称为肿瘤干细胞。肿瘤干细胞最早是在白血病患者体内中发
目的:评价时空关联成像(spatio-temporal image correlation, STIC)技术结合正交三平面模式与二维胎儿超声心动图技术对比胎儿心脏标准切面的显示率,探讨STIC技术在胎儿心脏检
目的:甲状腺细胞病理学Bethesda报告系统(TBSRTC)对Ⅲ、Ⅳ级结节的恶性风险评估存在争议,本文主要目的是通过检测MicroRNA-146b、-221、-222在甲状腺良恶性结节细针穿刺细胞液中
目的:了解本地区临床分离铜绿假单胞菌MexAB-OprM型外排系统和膜孔蛋白OprD2的表达情况及其与铜绿假单胞菌多重耐药的关系,为临床抗感染治疗及医院感染的监测和控制提供循证医学依据。方法:2008年7月至2009年6月我院住院患者送检标本分离铜绿假单胞菌381株(同一患者同类标本分离菌株不重复计入)。采用VITEK 2 Compact自动微生物分析仪进行细菌鉴定和药敏测定。选取多重耐药(对三类
研究背景:器官移植的理想目标是在不损伤机体及移植体情况下重建移植器官的生理功能,然而由于移植排斥反应导致移植物失活和一些严重的并发症制约了器官移植技术的发展。虽然随
目的探讨实时(?)阶超声造影在甲状腺结节诊断中应用的可行性;研究不同甲状腺结节实时(?)阶超声造影表现及实时(?)阶超声造影在甲状腺结节良恶性鉴别诊断中的价值。材料和方法
目的:研究C57BL/6小鼠形觉剥夺性近视(form-deprivation myopia, FDM)模型中,视网膜及巩膜中BMP/TGF-β信号通路中BMP-2的表达情况,探讨其在正常屈光发育及FDM形成中的作用。