随着经济全球化程度的不断加深,以及我国经济发展进入新常态化,国家领导人越来越重视创新在国民经济发展中的重要作用,党的“十九大”报告再次强调要把科技创新放在国家长期发展战略的核心位置。农业作为国民经济的基础产业,关乎国计民生,但因其随季节呈现周期性特点,并且表现出明显的地域性,因此在发展中受到诸多限制。在当前日益激烈的市场竞争背景下,农业企业必须依靠技术创新全面提升自主创新能力,进而持续提高综合生产能力,促进我国农业的长远发展。企业要进行创新,必然要尽可能多地进行研发活动,研发能力作为企业的一项软实力,代表着企业创新研发活动的投入产出比率,直接关乎公司的创新绩效。此外,随着现代企业制度的不断发展和完善,内部控制也越来越受到业界关注。基于此,为研究内部控制、研发能力和创新绩效三者之间的关系及影响路径,使企业能够从内部环境及资源投入角度出发来考量企业的创新绩效,总结自身在创新方面存在的不足及改进方向,本文首先对相关研究文献和理论进行总结梳理,并以此作为理论基础对内部控制、研发能力和创新绩效之间的关系做出理论分析并提出研究假设;其次选取2015-2017年农业上市公司面板数据,分析农业上市公司内部控制、研发能力和创新绩效的现状;最后通过构建多元回归模型,并以研发能力作为中介变量,实证分析农业上市公司内部控制、研发能力和创新绩效相互间的关系。研究结果显示:(1)内部控制对农业上市公司的研发能力和创新绩效均具有显著的正向影响,即良好的内部控制可以帮助企业更好地开展创新活动,有利于提高企业的研发能力,进而促进农业上市公司的创新绩效;(2)研发能力对农业上市公司的创新绩效具有显著的正向影响,说明较高的研发能力是企业自主创新的内在驱动力,对农业上市公司的创新产出具有正向的拉动作用;(3)研发能力在内部控制与农业上市公司的创新绩效之间存在部分中介效应,表明内部控制不仅可以对农业上市公司的创新绩效直接产生影响,也可以通过影响企业的研发能力对农业上市公司的创新绩效间接产生影响。根据研究结果及农业上市公司的发展现状,从企业内部控制体系建设、研发资金投入、创新人才培养、构建创新型企业文化及政策支持等方面,提出了相关建议。