我国普通高等学校的学费制度是当前社会普遍关注的重要且敏感的焦点问题。虽然，高等教育的学费由来已久，国际上也有普遍的认同，但是，在认识和实践方面的讨论仍在继续。国情、价值取向、经济发展水平和文化背景等差异都影响着关于学费的理念。收与不收，以及收多少，不同的理论学派有不同的解释，甚至是对立的观点。由于社会观念与行为方式的多样性，我们暂时还不能给出一个完全统一的解释，尽管如此，理性的思考，并且结合现实的国家体制、教育体制，选择考察的适当的切入点和角度进行讨论，力求给出恰如其分的解释是必要且可行的。 本文首先着重对我国现行的普通高等学校的学费制度进行了全面、系统的分析并追溯了我国高等教育的学费历史，然后，将我国的高等教育学费制度与其他国家的高等教育学费制度作横向比较分析。谁收益，谁负担是学费制度的基本原则，但是，以什么方式、按什么原则确定收费标准则存在不同的评论。其中，对合理性、操作性、使用管理办法等议论甚多，尤其是合理性是一个焦点。其次，本文通过可行性研究，提出了一种新的学费制度的选择——按学分收取学费。最后，文章对按学分收取学费的运行机制进行了研究，探讨完全学分制条件下的按学分收取学费的收费标准的确定、收费的模式和收费的实施、管理与保障体系。