20世纪80年代初,公司治理作为一个领域进入人们的视野。伴随着我国经济发展和金融市场的完善,公司治理问题日益成为政府机构、法律界和经济学界重点关注的对象之一。完善的公司治理结构作为现代企业制度的核心,不仅是现代企业制度的重要框架,而且是企业增强竞争力和提高经营绩效的必要条件。本文在研究国内外相关公司治理的理论文献基础上,围绕我国上市公司中最具有活力的板块—中小企业板进行研究。本文以2006年底之前在深圳中小企业板上市的公司作为研究样本,具体考察我国中小企业板上市公司治理结构与公司绩效之间的相关关系。本文还选择了同期上海主板市场中与中小企业板具有相同行业和相近规模的部分上市公司,建立了一个与中小企业板上市公司的对比性样本,通过与该样本公司治理结构与公司绩效的对比研究,提供另一角度了解我国中小企业板上市公司治理结构与公司绩效的关系状况。通过实证分析我们发现:中小企业板上市公司治理结构与公司绩效之间存在着一定的相关关系,第一大股东持股比例、第二到第十大股东持股比例、董事会会议次数、董事长与CEO兼任、高管人员持股比例、高管人员薪酬等对公司绩效都有显著影响。通过对比研究我们还得出了中小企业板上市公司盈利能力较强,融资相对困难,独立董事制度不完善,高层管理人员报酬与公司绩效关联性强于主板市场上市公司等结论。本文最后还指出目前中小企业板上市公司存在的一些治理缺陷,并提出相应的对策建议,这对完善我国中小企业板上市公司治理结构,提高公司绩效有一定的参考意义。