我国是一个洪涝灾害频繁、水资源短缺、水生态环境脆弱的国家,水资源问题困扰着国民经济中各个行业的发展。如何解决资源的短缺问题一直以来都是人们研究的重点,在提倡节约用水和减少水污染、重视生态用水之外,有计划地对有限的资源进行整合分配是一个比较可观的办法。水资源优化配置理论以系统分析法为主,包括优化模型和模拟模型,本文以优化模型为主,建立多目标函数以及相关约束进行求解。优化模型的求解算法包括传统优化算法和智能优化算法,传统优化算法具有诸多局限性且在搜索过程中过多地依赖初始值以及函数的梯度,而智能优化算法通用性很强,能够有效地解决多种问题。在智能优化算法中,遗传算法属于较为成熟的一种进化算法,一直具有良好的表现性能。本文阐述了对于水资源优化配置问题的算法的选择,主要分析了遗传算法基本原理与求解思想,对遗传算法的几个要素进行了归纳。将算法与水资源优化配置结合在一起,论文详细说明了遗传算法的求解步骤,并明确了相关参数的设定。在水资源配置系统中介绍了数据查询和配置计算两个模块的设计。通过对昌马灌区水资源配置实例的应用研究,说明遗传算法解决问题的合理性和有效性,具有一定的应用价值。概括了水资源优化配置今后的研究方向和算法应用的发展趋势。