预算制度是一个国家财政管理体系的基础,同时也反映了一个国家的政治制度、行政管理制度和经济制度的特点。绩效预算管理是政府在绩效管理体系中的核心组成内容,是通过衡量投入的支出结果为目标的预算管理模式。它重点是控制预算编制、执行监督的全过程,目的是通过过程控制和关注预算资金的产出和结果。2015年1月1日,我国实行了新的预算法,第一次以法律的形式指明了公共财政预算的绩效管理要求,为我国预算的管理体制由传统预算管理方式向绩效预算管理转型提供了法律依据。海关是国家重要的征税机关,在改革和创新绩效预算管理方面面临很多现实的困境和问题。本文结合海关的工作职能和海关行业特点,对绩效预算在海关系统的应用中存在的问题进行梳理、分析,研究并提出解决对策,从而进一步完善海关在国家经济发展中的相关职能。