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菲律宾蛤仔(Ruditapesphilippinarum),是我国重要的海产经济贝类之一,围绕其免疫功能进行研究,培育优良的蛤仔品种,对贝类遗传育种有重要意义。
本研究围绕菲律宾蛤仔,利用生物信息学和分子生物学手段初步研究了补体C3分子集齐亚型的序列结构、表达特性和免疫功能。利用生物信息学手段对实验室已有的蛤仔全基因组数据进行挖掘,获得5个菲律宾蛤仔补体C3亚型基因(分别命名为RpC3-1、RpC3-2、RpC3-3、RpC3-4和RpC3-5)的序列,对其结构进行了分析。利用分子生物学手段,通过对蛤仔进行免疫胁迫,探究5个C3补体亚型基因的表达特性。经过对其氨基酸序列的比对,仅在RpC3-2、RpC3-3和RpC3-5中发现ANATO结构域。选取RpC3-3进行研究,获得其ANATOA结构域的碱基序列,并进行体外重组蛋白,进而对RpC3蛋白的抑菌性进行了检测。本文针对菲律宾蛤仔补体C3基因的研究,对于了解无脊椎动物补体C3分子的特征和作用,丰富和发展无脊椎动物固有免疫的研究具有一定的意义。
对五个菲律宾蛤仔补体C3基因的序列结构进行了研究。结构上说,五个RpC3中最长的是RpC3-4,最短的是RpC3-1,其中RpC3-2、RpC3-3和RpC3-4具有较高的相似性。OFR上也有相同的大小顺序,并且具有补体C3基因的特征保守结构域,全部5个RpC3都含有α2-macroglobulinfamily结构域(A2M)结构域、α-macroglobulin补体成分(A2M_comp)和α-macroglobulin受体(A2M_recep)。RpC3-2、RpC3-3、RpC3-4和RpC3-5含有globulinfamilyN-terminal结构域(A2M_N_2),RpC3-1、RpC3-2、RpC3-3和RpC3-4均含有一个C3、C4和C5蛋白家族特有的NetrinC-terminal结构域(C345C)。
LPS注射后,五个RpC3的mRNA的表达量都呈现类似的先升高后降低的趋势,均在24小时达到表达量最大,48小时后表达量不再出现明显变化。PGN注射的实验组中RpC3的mRNA的表达量升高,和对照组有一定差异,24小时出现表达量最大值,但是和对照组的差异没有注射LPS的实验组大。注射PolyI:C后,RpC3的mRNA的表达量实验组和对照组的差异不明显,注射后实验组表达量增加缓慢,24小时也会出现表达量最大值,但是实验组和对照组的差异是三个实验组中最小的(P<0.05)。
五个RpC3基因对于三种免疫刺激,在血淋巴中都有相应的免疫反应,注射LPS和PGN的实验组都有明显的RpC3基因的mRNA的表达量升高,注射PolyI:C的实验组中,RpC3基因的mRNA的表达量也有升高,但是实验组和对照组的差异不大。五种基因的mRNA的表达量的变化趋势基本一致。注射LPS的实验组中,RpC3基因的mRNA的表达量都会出现升高降低再升高的变化趋势,3小时和48小时时间点的表达量都较高,48小时表达量最大。注射PolyI:C后,5种RpC3基因的mRNA的表达量均在12小时达到最大,但是实验组和对照组的差异并不是很大,在多个时间点上,实验组和对照组的表达量接近。
将ANATO结构域作为目的基因,对其进行原核表达获得RpC3a蛋白,并对蛋白活性进行了检测。在抑菌实验中,RpC3a蛋白对革兰氏阳性菌的抑菌效果更加明显,在后续的实验中,RpC3a蛋白也表现出对革兰氏阳性菌生长的更明显的抑制效果。
本研究围绕菲律宾蛤仔,利用生物信息学和分子生物学手段初步研究了补体C3分子集齐亚型的序列结构、表达特性和免疫功能。利用生物信息学手段对实验室已有的蛤仔全基因组数据进行挖掘,获得5个菲律宾蛤仔补体C3亚型基因(分别命名为RpC3-1、RpC3-2、RpC3-3、RpC3-4和RpC3-5)的序列,对其结构进行了分析。利用分子生物学手段,通过对蛤仔进行免疫胁迫,探究5个C3补体亚型基因的表达特性。经过对其氨基酸序列的比对,仅在RpC3-2、RpC3-3和RpC3-5中发现ANATO结构域。选取RpC3-3进行研究,获得其ANATOA结构域的碱基序列,并进行体外重组蛋白,进而对RpC3蛋白的抑菌性进行了检测。本文针对菲律宾蛤仔补体C3基因的研究,对于了解无脊椎动物补体C3分子的特征和作用,丰富和发展无脊椎动物固有免疫的研究具有一定的意义。
对五个菲律宾蛤仔补体C3基因的序列结构进行了研究。结构上说,五个RpC3中最长的是RpC3-4,最短的是RpC3-1,其中RpC3-2、RpC3-3和RpC3-4具有较高的相似性。OFR上也有相同的大小顺序,并且具有补体C3基因的特征保守结构域,全部5个RpC3都含有α2-macroglobulinfamily结构域(A2M)结构域、α-macroglobulin补体成分(A2M_comp)和α-macroglobulin受体(A2M_recep)。RpC3-2、RpC3-3、RpC3-4和RpC3-5含有globulinfamilyN-terminal结构域(A2M_N_2),RpC3-1、RpC3-2、RpC3-3和RpC3-4均含有一个C3、C4和C5蛋白家族特有的NetrinC-terminal结构域(C345C)。
LPS注射后,五个RpC3的mRNA的表达量都呈现类似的先升高后降低的趋势,均在24小时达到表达量最大,48小时后表达量不再出现明显变化。PGN注射的实验组中RpC3的mRNA的表达量升高,和对照组有一定差异,24小时出现表达量最大值,但是和对照组的差异没有注射LPS的实验组大。注射PolyI:C后,RpC3的mRNA的表达量实验组和对照组的差异不明显,注射后实验组表达量增加缓慢,24小时也会出现表达量最大值,但是实验组和对照组的差异是三个实验组中最小的(P<0.05)。
五个RpC3基因对于三种免疫刺激,在血淋巴中都有相应的免疫反应,注射LPS和PGN的实验组都有明显的RpC3基因的mRNA的表达量升高,注射PolyI:C的实验组中,RpC3基因的mRNA的表达量也有升高,但是实验组和对照组的差异不大。五种基因的mRNA的表达量的变化趋势基本一致。注射LPS的实验组中,RpC3基因的mRNA的表达量都会出现升高降低再升高的变化趋势,3小时和48小时时间点的表达量都较高,48小时表达量最大。注射PolyI:C后,5种RpC3基因的mRNA的表达量均在12小时达到最大,但是实验组和对照组的差异并不是很大,在多个时间点上,实验组和对照组的表达量接近。
将ANATO结构域作为目的基因,对其进行原核表达获得RpC3a蛋白,并对蛋白活性进行了检测。在抑菌实验中,RpC3a蛋白对革兰氏阳性菌的抑菌效果更加明显,在后续的实验中,RpC3a蛋白也表现出对革兰氏阳性菌生长的更明显的抑制效果。