研究背景：近几年,大量的研究对肝癌进行了全基因组或外显子组重测序,并找到了大量蛋白编码基因的突变。但是,这些研究只关注有限数量的肝癌候选基因,仍有很多重要的基因突变值得去进一步研究。主要发现：在这个研究中,我们主要整合了13个不同来源的肝癌突变数据,从而找出肝癌发生相关的关键致病基因和高频突变基因。我们共找出45个肝细胞癌关键致病基因(突变率>5%),包括众所周知的癌症基因TP53、CTNNB1、 AXINl以及最近发现的肝细胞癌相关基因COL11A1、USH2A、LRPIB、ALB、 GRPR98等,其中TNN、PCLO、RYR2、MUC4为未被报道过的肝细胞癌高频突变基因(>10%)。在进一步预后分析中,7个基因同时在生存分析和Cox比例风险模型分析中显示与肝细胞癌预后显著相关。通过基因共表达网络分析和富集分析,我们共找到8条富集显著的突变通路和26种基因富集显著的突变功能,主要与细胞转移、转录、复制、免疫反应等功能相关。结论：以上这些肝癌致病相关基因的发现为肝癌治疗提供了潜在靶标。同时,我们的工作表明对同一主题的研究进行整合分析既可以增强结果的统计学强度,又能重新发现被单个研究所掩盖的具有生物学意义的事件或信息。这种类型的生物信息学方法能让研究者更好地利用激增的生物数据,加速癌症等复杂疾病的攻克。