论文部分内容阅读
研究目的:分别探索精神分裂症和心脏代谢性疾病的候选基因和信号通路,鉴定二者共同的候选基因和信号通路。研究方法:从已发表的研究中分别获取精神分裂症和心脏代谢性疾病（包括肥胖、冠状动脉性心脏病、2型糖尿病、高密度脂蛋白水平异常、低密度脂蛋白水平异常、总胆固醇和甘油三酯水平异常）的全基因组关联研究（Genome-wide association studies,GWAS）数据,以及各组织表达数量性状座位（Expression quantitative trait loci,eQTL）数据。分别用FUMA、Sherlock、SMR、UTMOST、FOCUS和DEPICT分析方法预测精神分裂症和心脏代谢性疾病的候选基因,以及用GSA-SNP2和MAGMA分析方法鉴定与精神分裂症和心脏代谢性疾病有关的信号通路,整合分析结果并鉴定精神分裂症和心脏代谢性疾病共病的候选基因和信号通路。研究结果:整合多种分析方法的结果,发现VRK2、NT5C2、INO80E、YPEL3和MAPK3是精神分裂症与肥胖的共同候选基因,NT5C2、FES和FURIN是精神分裂症与冠状动脉性心脏病的共同候选基因,ARL6IP4、OGFOD2、PITPNM2、CDK2AP1、C12orf65、ABCB9、SETD8、MPHOSPH9、SREBF1、TOM1L2和GATAD2A是精神分裂症与2型糖尿病的共同候选基因,SLC39A8、AMBRA1、C12orf65和SETD8是精神分裂症与高密度脂蛋白水平异常的共同候选基因,GATAD2A和TM6SF2是精神分裂症、总胆固醇和甘油三酯水平异常的共同候选基因。此外,我们还发现MAPK-TRK信号通路与精神分裂症和肥胖发病有关,生长激素信号通路和胰岛素分泌调节信号通路与精神分裂症和2型糖尿病发病有关。结论:精神分裂症与心脏代谢性疾病存在21个共同候选基因（VRK2、SLC39A8、NT5C2、AMBRA1、ARL6IP4、OGFOD2、PITPNM2、CDK2AP1、C12orf65、ABCB9、SETD8、MPHOSPH9、FES、FURIN、INO80E、YPEL3、MAPK3、SREBF1、TOM1L2、GATAD2A和TM6SF2）和3条共同信号通路（MAPK-TRK信号通路、生长激素信号通路和胰岛素分泌调节信号通路）。