最近几年，中央政府及地方政府开始加大了行政体制改革力度，重视政府向法治和服务型方向转变职能。政府绩效审计也向目标责任制考核、效能监察、满意度评议、社会服务承诺制、行政效能评估等形式不断发展，并结合标杆管理的理论，取得了比较好的社会影响。使用标杆管理不仅能够提升我们的管理服务水平及工作能力，还能够起到不断改进政府部门绩效审计的作用。因此，我们应该重视在政府部门设立标杆管理方式，解决政府绩效中的不足，借助新的管理手段和管理体系，综合应用多种方法，提高政府职能机构的绩效管理水平。　　本文运用文献研究法、案例研究法、系统分析法等方法，依据相关理论知识，在现有理论成果的基础上进行了深入研究，以地方政府职能机构标杆管理及绩效审计研究为研究课题，从中总结出以下几点：　　（1）Y市科技局应用标杆管理及绩效审计存在的问题。主要有缺乏缺乏标杆管理理念；绩效审计资料提供不完整；法律保障不足；政府绩效审计人员专业性与全面性不足。　　（2）针对上述文章中所总结出的问题进行分析，作者在学习研究了相关理论资料之后，搜集Y市科技局标杆管理及绩效审计工作的真实素材，并结合其他地区的先进经验，提出了提升地方政府职能机构标杆管理及政府绩效审计水平的完善对策。主要分以下几个方面：进一步强化标杆管理及绩效审计的理念；完善绩效审计制度及手段；为政府职能机构绩效审计提供法律保障；提升绩效审计人员的综合素质。