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猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)、猪瘟(Classical swine fever,CSF)、猪圆环病毒病(Porcine circovirus disease,PCVD)、猪伪狂犬病(Pseudorabies,PR)是我国规模猪场、种猪场主要的4种垂直传播性疫病,临床上主要引起种猪繁殖障碍、仔猪呼吸系统疾病以及免疫抑制,从而引发其他疫病继发感染,最终给养猪业造成巨大的经济损失。我国于2012年颁布并实施《国家中长期动物疫病防治规划(2012-2020年)》,开始在种猪场对PRRS、CSF、PR实施垂直净化措施。而了解感染种猪的比例是开展上述净化工作的前提和基础,为此,本研究在2011-2013年间利用PCR、荧光PCR、基因序列测定和ELISA方法对全国29个省(市、自治区)的98个原种猪场进行PRRSV、CSFV、PCV2病原监测和PRV野毒抗体监测,旨在探明这4种疫病在我国原种猪群中的流行趋势。2011-2013年,我国原种猪场的PCV2检出率最高,场阳性率达89.04%-93.15%,个体阳性率达22.57%-26.67%,但感染趋势总体保持平稳;同时发现,PCV2在扁桃体中的检出率显著高于血清(个体阳性率:20.75%vs2.31%,OR=1 1.09,95%Cl=7.62-16.13,p<0.001)。PRRSV检出率次之,场阳性率达24.32%-28.28%,个体阳性率达0.96%-1.76%,感染趋势总体上也保持平稳;PRRSV在扁桃体中的检出率亦略高于血清。CSFV检出率最低,2011-2012年,均未检出CSFV,2013年,在3.23%的猪场中检出CSFV,个体阳性率为0.09%。PRV野毒抗体检出率较高,2011年至2012年,野毒抗体阳性猪场和阳性猪的比例均显著升高(场阳性率由36.71%升至64.56%,个体阳性率由12.78%升至16.6%),2012-2013年,野毒抗体阳性猪的比例继续升高(个体阳性率升至23.51%),但阳性猪场的比例降低(场阳性率降至39.24%)。原种猪群中的PRRSV、PCV2、PRV感染分布如此广泛,可能会增加原种猪场向扩繁场和商品猪场传播疫病的风险。另外,我国原种猪场上述4种疫病的混合感染现象也比较严重,其中PCV2和PRV、PRRSV和PCV2的混合感染最为普遍,提示我国原种猪场在引种、饲养管理等疫病防控方面尚存在一些疏漏,应进一步加强其审批和管理,推动其淘汰净化阳性猪群。通过荧光PCR和全基因序列测定,进一步对PRRSV和PCV2感染毒株的基因亚型进行深入分析。结果显示,我国原种猪场中同时存在PRRSV美洲型和欧洲型,美洲型中又存在美洲型经典株和美洲型变异株。在2013年,还发现了与NADC30株(2008年于美国分离,属NA3型)同源性很高的新毒株。2011年,美洲型变异株检出率最高(占0.89%),之后缓慢下降至0.5%;美洲型经典株检出率次之(占0.5%),之后缓慢上升至1.1 5%;欧洲型检出率最低(占0.26%),之后持续下降,至2013年检出率仅为0.03%。2013年,美洲型经典株取代美洲型变异株,成为优势流行基因亚型。PCV2分离株的研究结果显示,原种猪场中同时存在2a(2D、2E、2F)、2b(1A、1B、1C)、重组群等多种PCV2基因亚型,其中2b-1C亚型检出率最高(占54.35%-62.5%),是优势流行基因亚型。其次是2a-2F(占18.75%-23.91%)。以上结果表明,PRRSV和PCV2均存在2种基因型或基因亚型共感染的情况。多种基因型毒株共感染,可能会导致重组病毒的出现,因此,建议原种猪场应对引进种猪加强病原感染的监测,防止引入外源病毒,同时,应对共感染猪群加强监测,及时发现新型毒株。此外,本研究还对原种猪场进行了系统性的调查问卷,对种公猪与种母猪、后备母猪与经产母猪、地方猪种与引进猪种中PRRSV、PCV2、PRV的检出率进行了差异显著性分析,结果发现,PRRSV和PCV2感染时,种公猪的检出率大于种母猪,后备母猪的检出率大于经产母猪,地方猪种的检出率大于引进猪种,根据这一结果,推测种公猪、后备母猪、地方猪种可能是PRRSV和PCV2感染的风险因素。应用同样的方法分析后,推测种母猪、经产母猪、引进猪种可能是PRV感染的风险因素。建议应根据不同疫病的流行特征对风险较大的猪群进行重点监测。综上所述,本研究摸清了 2011-2013年我国原种猪场PRRSV、CSFV、PCV2、PRV在群间、空间、时间的分布趋势,为种猪场实施垂直净化提供了科学依据。