GPR54基因C-816T和T-754C的多态性与牛性成熟关联性研究

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GPR54基因是牛性成熟状的重要候选基因之一,本文选择42头安徽本地黄牛、44头西门塔尔牛及其杂交育种群116头作为试验群体,分析牛GPR54基因5’调控区的SNPs以及不同基因型启动子的启动效率和牛性成熟状之间的关联性。试验提取牛血液基因组后,通过测序鉴别SNP位点,双荧光素酶报告基因验证其SNP位点对启动子效率的影响。结果表明:1.GPR54基因的启动子区GPR973序列存在两个SNPs位点,分别是距离CDS起点上游第816位和754位:C-816T和T-754C,西门塔尔牛和安徽地方黄牛分别只有1种基因型,西门塔尔牛的基因型全部为CCTT,安徽地方黄牛的基因型全部为TTCC,分析其单倍型结果显示连锁不平衡。2.C-816T突变位点附近存在TCF-1和AP-3(2)转录因子结合位点,T-754C附近及其本身存在TFIID、NF-1、CAC-binding_pro、TCF-1转录因子以及F位点等。从C-816T到T-754C形成一个以TCF-1开头结尾的复合转录因子结合区域,其中还包含一个TFIID结合的G/TATAAA盒。经过预测,本目的片段含有一个从-878bp至-638bp的启动子区域。3.通过双荧光素酶报告基因验证了西门塔尔牛和安徽地方黄牛不同GPR973基因型的启动子效率,报告基因验证两种单倍型的启动子存在明显差异,其中-816CT-754启动子的效率要比-816TC-754提高34.31%(p<0.01)。4.通过对不同品种牛GPR54进行实时荧光定量PCR反应,结果显示与双报告基因检测结果一致。C-816CT-754T牛和T-816TC-754C牛的表达差异明显(p<0.05),其中C-816CT-754T牛是T-816TC-754C牛的2.6倍。5.通过对不同品种牛进行关联分析,基因型为816CC754TT牛的初情期与基因型为816TT754CC牛的初情期相比提前了1.28月,且差异极显著(p<0.01)。
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