随着国家对职业教育的重视,高等职业教育在我国蓬勃发展起来,新的办学模式层出不穷,但诸如行业办学一些传统的办学方式在市场经济的冲击下显得无法适应教育市场的变化。而作为最了解行业发展前沿动态的行业办学,如果不能在激烈的市场竞争下生存,其优势就不复存在,损失是巨大的。M职业学院就是这样一家有着多年行业办学经验的高等职业学院,由于一度偏离了职业教育的方向,再次进入职教行业时,其组织结构由于体制混杂和机制僵化而导致自生出现了问题。本文利用组织结构理论和委托代理理论,旨在能够对学院现状提出解决方案,同时对于有着相似情形的其他行业院校也有现实的借鉴意义。本文首先通过对学院机构沿革的介绍,从机构和人员两方面描述组织现状,分析其存在的问题主要包括体制混杂、机制僵化和发展思路不清晰,并指出体制机制问题是学院一切问题的根源。接着有针对性的提出了学院改制的方案,通过政校分离的方式,以委托代理理论为保障,对影响学院组织结构的因素进行了定性分析。结果表明,战略因素对组织结构有着重大影响。要调整学院组织结构,必须先制定学院下一步的发展战略。因此,通过层次分析法对SWOT分析法的改进,制定了学院下一步的战略。结果表明,学院在下一阶段需要解决的问题排序如下：优化管理结构,树立学院品牌,突出教学特色,提高教学质量。在此基础上,再次利用层次分析法对影响学院组织结构的因素进行排序。总排序表明,影响学院组织结构的主要因素依次为：人才发展规划战略、加快发展现代职业教育战略、管理水平、学院是否拥有决策权和人事权。最后,根据以教师为根本、以知识为中心、以普适为准绳、以灵活机动为特点的四原则重新构建了M职业学院的组织结构。M职业学院改制与改革的研究不仅对学院理顺自身关系有着重大影响,而且对于还处于行业办学面临体制机制困境的单位提供了一些思路,有利于高等职业教育的发展。