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C5是补体系统中一种组分，在机体免疫防御、维持机体稳定中起重要作用。因此，本研究以C5基因作为奶牛乳房炎的候选基因，选取605头中国荷斯坦奶牛为研究对象，采用巢式PCR、DNA测序、创造酶切位点法PCR及SSCP方法进行SNP的筛选，发现在中国荷斯坦牛C5基因第30内含子、34内含子、41外显子存在单核苷酸多态性(SNPs)，分别为T73830G、C81733G和T92133A，均为首次报道的位点。研究发现，三个突变位点突变等位基因的频率分别为0.80，0.28，0.25；PIC值分别为0.27、0.32、0.32，且均为中度多态，遗传变异较大。此外，经X2适合性检验，这三个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态。
分析605头荷斯坦奶牛C5基因T73830G、C81733G和T92133A三个位点的多态性与305d产奶量、乳蛋白率、乳脂率与SCS这四个产奶性状，结果发现T73830G和T92133A两个位点在305 d产奶量、乳蛋白率、乳脂率有显著影响，对SCS无显著影响。对C5基因3个多态位点T73830G、C81733G和T92133A进行了单倍型组合分析，共构建出8种单倍型，只出现21种单倍型组合。结果显示H4H1单倍型组合个体乳脂率最高；单倍型组合H2H6个体在乳蛋白率上最高，单倍型组合H4H6个体的305天产奶量最高，单倍型组合H4H1个体的体细胞评分最低，为抗乳腺炎最强的单倍型组合。
此外，本试验还随机选取301头荷斯坦奶牛研究牛群中C5基因的三个SNP位点及单倍型组合与ACH50和CH50值之间的关系。研究结果表明，三个位点与ACH50和CH50值均没有显著差异，但单倍型组合H1H5个体的ACH50的水平最高，各单倍型组合个体与CH50之间没有显著差异。