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本试验在新疆伊犁地区两个新疆褐牛养殖场采集血样145头份,肌肉样20头份,采用PCR-RFLP方法对新疆褐牛Leptin基因第二外显子E2JW和E2FB两个位点的单核苷酸多态性进行研究,并对新疆褐牛半腱肌、背最长肌进行了剪切力、肌苷酸含量、脂肪含量、羟脯氨酸含量、肌纤维直径和密度进行了研究,比较分析了Leptin基因第二外显子E2JW位点的多态性对新疆褐牛肉质特性的影响。试验结果为:1、新疆褐牛Leptin基因第二外显子E2JW和E2FB两个位点存在多态性。2、新疆褐牛Leptin基因第2外显子E2JW位点可能缺少TT基因型个体,E2FB位点可能缺少CC基因型个体。3、在E2JW位点单核苷酸多态性中A等位基因为优势等位基因,且优势明显(0.91);E2FB位点单核苷酸多态性中T等位基因为优势等位基因,但优势不明显(0.52)。4、E2JW位点SNP中,AA基因型比AT基因型个体具有更高的肌内脂肪含量,且差异极显著(P＜0.01)。5、E2JW位点SNP中,AA基因型剪切力高于AT基因型个体,且差异极显著(P＜0.01)。6、E2JW位点SNP对胶原蛋白含量、肌苷酸含量、肌纤维直径、肌纤维密度等性状指标没有显著影响(P＞0.05)。上述结果表明E2JW位点SNP对肌肉的脂肪含量和剪切力有较大影响,对胶原蛋白含量、肌苷酸含量、肌纤维直径、肌纤维密度等性状指标没有显著影响。