【摘 要】
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微生物基因组文库的构建有利于得到性状各异的优势菌株,便于更加深入地探究微生物的应用价值及遗传物质的生物学信息。为了高效地实现基因组规模的扰动来建立表型各异的菌株文库,本次研究基于解脂酵母自身非同源末端修复机制,开发了一种基因组建库技术。本次研究发现高产菌株中的外源片段通过非同源末端连接(Non-homologous end joining,NHEJ)的方式随机整合到解脂酵母基因组的不同位点。并成功
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微生物基因组文库的构建有利于得到性状各异的优势菌株,便于更加深入地探究微生物的应用价值及遗传物质的生物学信息。为了高效地实现基因组规模的扰动来建立表型各异的菌株文库,本次研究基于解脂酵母自身非同源末端修复机制,开发了一种基因组建库技术。本次研究发现高产菌株中的外源片段通过非同源末端连接(Non-homologous end joining,NHEJ)的方式随机整合到解脂酵母基因组的不同位点。并成功验证两个靶点的敲除对脂肪醇产量有显著的提升。为进一步探究解脂酵母NHEJ修复机制在获得多样性菌株、挖掘基因组生物学信息方面的潜力,通过对解脂酵母非同源重组机制中的关键连接酶DL4及协同因子PAXX和XRCC4的过表达,使得荧光强度提升了4.67倍;同时,截短Ura标签的启动子得到高压力筛选标签,荧光强度提升了22.74倍;采用优化后的多轮迭代转化流程,荧光强度提升了1.87倍。综合上述三方面的优化,在解脂酵母中成功建立了基于非同源末端连接机制的微生物建库技术。该技术实现了多个外源片段随机地插入到基因组中,在96小时内获得大量多样性菌株。利用NHEJ建库技术能够将CrtE、CrtB及CrtI三个外源片段同时随机地整合到解脂酵母基因组中,得到一系列番茄红素产量各异的菌株。与依赖同源重组机制整合到r DNA位点的菌株相比,利用NHEJ建库技术得到的菌株,番茄红素产量提升了23.88倍。同时,利用该技术分别将重组酶识别位点lox P及vox高效随机地整合到解脂酵母基因组上,lox P位点的整合数量达到65,vox位点的整合数量达到53,为重组酶系统介导的基因组重排技术在解脂酵母中的应用创造了有利的条件。这种高效便捷的基因组操作技术,为进一步研究解脂酵母基因的生物学功能及后续建库技术的开发提供了有效的技术平台。
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