ALOX5AP基因转录调控区SNPs与河南汉族人群缺血性脑卒中的相关性

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研究背景和目的:缺血性脑卒中是遗传因素和环境因素共同作用而导致的多基因遗传疾病,其发病机制异常复杂。动脉粥样硬化在机体中的形成和发展是缺血性脑卒中发生的重要病理生理基础,而炎症反应是动脉粥样硬化形成的关键性致病机制,其通过促进粥样斑块脂纹的形成,稳定斑块与不稳定斑块的发展和斑块的破裂,与心脑血管疾病的发生密切相关。2004年deCODE研究小组通过全基因组筛查在冰岛人群中首次发现了脑卒中的独立风险基因—ALOX5AP。该基因编码合成的5-脂氧合酶激活蛋白(FLAP)是白三烯(LT)生物合成中的必需物质。LT是炎症家族的重要组成成分,其引发的病理机制包括白细胞的激活、促使单核细胞与血管内壁的黏附、增加血管壁的通透性等,从而引起动脉粥样硬化的发生。FLAP因影响LT的合成而在动脉粥样硬化形成中起重要作用,与缺血性脑卒中的发生密切相关。2005年deCODE研究小组又一研究发现,携带ALOX5AP基因SG13S25、SG13S32、 SG13S114、SG13S89组成的易感单倍型HapA的心肌梗死患者的二羟酸白三烯水平明显高于不携带该单体型的患者。但是,研究者在对ALOX5AP基因进行基因组序列扫描时,却没发现任何引起氨基酸序列改变的SNPs。这些研究结果提示,ALOX5AP基因与缺血性卒中的关系很可能建立在基因转录调控水平上。综上,本研究选取对ALOX5AP基因转录调控起重要作用的启动子区rs17222919位点和第一内含子区rs9579646位点,采用TaqMan-PCR基因分型技术对810例缺血性脑卒中患者及825例正常对照进行关联研究,探讨ALOX5AP基因转录调控区单核苷酸多态性与河南汉族人群缺血性脑卒中发生的相关性,为缺血性脑卒中的防治提供理论依据。研究对象:随机选取2008年3月至2010年11月期间来自河南省二级甲等以上医院神经内科住院的缺血性脑卒中患者810例作为病例组,其中男416例,女394例,年龄56.1±10.6岁。缺血性脑卒中患者的诊断均符2006年WHO确定的缺血性脑卒中诊断标准,并经临床检查(病史、体征、生化检验、头颅CT和/或MRI)证实,同时排除低血容量、感染所致的脑梗死和无症状性脑梗死。按照TOAST分型法,将病例组分为大动脉粥样硬化性卒中(LAA)616例、小动脉闭塞性卒中(SAA)78例、未知原因的缺血性脑卒中(SUE)116例。随机选取825例年龄、性别与病例组匹配的同期健康体检个体作为正常对照,其中男428例,女397例,年龄55.3±10.3岁。本研究个体之间无血缘关系,均为河南汉族人群。本研究获郑州大学伦理委员会的批准,所有参加人员均知情同意。研究方法:运用酚-氯仿法提取全血基因组DNA;超微量核酸蛋白测定仪检测样本DNA的浓度和纯度:采用基因分型精确度高且通量大的TaqMan-PCR技术进行基因型检测,其中使用TaqMan-MGB探针检测rs9579646位点的基因型,使用TaqMan探针检测rs17222919位点的基因型;直接测序检验分型结果的准确性。实验数据采用SPSS19.0统计软件包进行统计学处理。IS组与正常对照组间的基因型频率与等位基因频率分布差异采用四格表资料的χ2检验,且以比数比(Odds Ratio, OR)及95%可信区间(C1)估计基因突变对疾病发生的相对危险度。采用SHEsis软件进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验、单倍型分析及连锁不平衡检验。应用Logistic回归模型分析基因与环境危险因素在缺血性脑卒中发病中的交互作用。检验水准a=0.05。结果:1.rs17222919位点的TG、GG基因型频率和G等位基因频率在IS组与对照组间的分布差异显著(P<0.05),且rs17222919位点在显性遗传模式下与IS的发生相关。2.IS分型研究发现,携带rs9579646位点GG基因型和G等位基因的个体发生SAA的风险性增加(OR=2.317,95%CI:1.100~4.882;OR=1.474,95%CI:1.052~2.066).携带rs17222919位点GG基因型的个体发生LAA的风险性降低(OR=0.519,95%CI:0.295~0.914);携带TG基因型的个体发生SUE的风险降低(OR=0.554,95%CI:0.352~0.870)。3.分层分析发现,rs17222919位点的GG基因型可降低男性个体和年龄(?)50岁个体IS发生的风险(OR=0.443,95%CI:0.207~0.949;OR=0.312,95%CI:0.116~0.840),TG基因型和G等位基因可降低女性个体和年龄>50岁个体IS发生的风险(OR=0.602,95%CI:0.446-0.812;OR=0.697,95%CI:0.548~0.886)&(OR=0.727,95%CI:0.562~0.941:OR=0.796,95%CI:0.646~0.982)。4.基因-环境交互作用分析发现,位点rs17222919TG+GG基因型分别与高血压、糖尿病、吸烟之间在IS发病中均存在负向交互作用。5.单倍型分析发现,携带A-G单倍型的个体发生IS的风险降低(OR=0.712,95%CI:0.598-0.848);而携带A-T、G-G单倍型的个体发生IS的风险增加(OR=1.281,95%CI:1.100~1.495;OR=2.229,95%CI:1.288~3.857)。结论:1.rs17222919位点可能与河南汉族人群IS发生密切相关,且GG基因型是LAA发生的保护因子,TG基因型是SUE发生的保护因子。rs17222919T/G位点突变可能对IS发病的环境危险因素高血压、糖尿病、吸烟暴露的效应具有减弱作用。2.rs9579646位点GG基因型和G等位基因可能是河南汉族人群SAA发病的风险因子。3.rs17222919、rs9579646两位点的A-T、G-G单倍型可能是河南汉族人群IS发生的风险因子,而A-G单倍型可能对河南汉族人群IS的发生具有保护性作用。
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