朊病毒病相关LncRNA表达谱分析研究

来源 :黑龙江八一农垦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shelllbw
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[背景]朊病毒病是一种高致病性,高致死性的神经退行性疾病,是由于细胞内正常的朊蛋白发生构象改变,形成的一种抗逆性极强,能够大量聚集在神经细胞内的有毒蛋白PrPSc,导致细胞代谢紊乱,神经细胞大量死亡。现已证明,人们误食感染疯牛病的牛肉后,会引起人类朊病毒病(克雅氏病),由此可见,朊病毒病已经打破了种间屏障,成为严重威胁人类健康的一种人兽共患病。经过朊病毒学者们的不懈努力和深入研究,发现细胞内可能存在与朊病毒感染、致病相关的宿主因子。LncRNA是近些年发现的一种重要的长链非编码RNA分析,长度大于200nt,参与了生命过程中一系列重要进程,可能是朊病毒致病的重要协助因子,它的研究给朊病毒病的发病机理带来了希望,因此,我们对与朊病毒病相关的LncRNA分子进行了初步的筛选与鉴定。[方法]本实验通过建立朊病毒小鼠鼠脑LncRNA和mRNA表达谱,根据分析结果,初步筛选出与朊病毒致病相关的LncRNA分子;然后使用生物信息学可高精度分辨出功能性LncRNA分子的靶向关系,参与生物学进程等;利用荧光定量PCR和Western blotting定量分析功能性LncRNA分子对朊蛋白基因以及朊病毒复制的作用。[结果]建立朊病毒病模型小鼠脑部LncRNA和mRNA表达谱,并通过荧光定量PCR进行了验证,最终检测出6条LncRNA表达量相比对照组下调,13条LncRNA表达量相比对照组上调;建立了小鼠海马组织中mRNA芯片,共检测出170条差异表达的mRNA分子,其中25条mRNA表达下调,145条miRNA表达上调。通过生物信息学分析预测,得到差异性表达LncRNA作用的靶基因以及靶基因的功能和参与细胞信号转导通路。荧光定量PCR分析得知过表达LncRNA-2对Prnp基因并没有显著影响,WesternBlotting检测ScN2a细胞内PrPSc含量说明,过表达LnRNA-2后能够抑制PrPSc蛋白的复制。[结论]本实验建立了完整的朊病毒病小鼠海马组织LncRNA以及mRNA表达谱,通过生物信息学分析初步筛选出了LnRNA-2进行深入研究,利用荧光定量PCR和Westernblotting初步验证了该分子高表达之后能够抑制朊病毒复制。为后续研究长链非编码RNA以及朊病毒相关分子伴侣提供了一个理论的支持,奠定了基础。
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