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漠河盆地科学钻探井MK-1位于漠河盆地永久冻土区，其目的是勘探天然气水合物以及其它油气资源。目前对微生物在地下沉积物尤其是冷环境地下沉积物中的数量、多样性和群落分布都知之甚少。样品的采集由地表延伸至井下500m。漠河盆地MK-1地下细菌多样性有其独特的分布规律，在漠河盆地科学钻探井MK-1地下110m冷环境样品中发现大量嗜热微生物存在的证据，本研究针对这些冷环境中的嗜热菌进行了克隆文库分析和分离培养。分别用细菌和古菌16SrDNA引物PCR扩增。 其目的是通过细菌16SrDNA分析漠河科学实验井地下不同深度沉积物样品中细菌多样性和群落结构。为微生物勘探提供依据。实验方法如下（1）微生物群落分析：岩芯样品DNA提取和纯化→多重PCR→连接质粒载体→转化到大肠杆菌DH5α→蓝白斑筛选→选出阳性菌落单克隆→测序→系统发育分析。（2）冷环境中嗜热微生物分离培养：配制PYGV培养基→制备稀释不同梯度的菌液→涂平板后在10℃，25℃，55℃恒温培养→分离培养选出单克隆→培养新鲜菌液，测序→系统发育分析。 实验中总共成功测序了500个细菌16SrDNA基因，根据其对比结果可将其分为7个菌门。它们分别为α-Proteobacterias,γ-Proteobacterias,δ-Proteobacterias,Firmicutes,Deinococcus-Thermus,Bacteroidetes和Actinobacteria。发现嗜热细菌与栖热菌属(Thermus)，地芽孢杆菌属(Geobacillus)和厌氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus)有较近的亲缘关系，分离培养得到三种地芽孢杆菌属(Geobacillus)的细菌，其相似度均为100％。 在样品中没有发现古菌以及与甲烷代谢有关的功能基因存在的证据。随着深度的增加细菌的种类逐渐减少，优势种群的的数量变得更加突出。110m，232m，300m样品中出现适冷菌，但丰度不大。随着深度的增加，嗜冷菌逐渐减少至消失。每一个样品中均发现了与氮代谢和硫代谢有关的微生物。类似乳杆菌的细菌丰度在302m，379m和478m丰度较大，并且其丰度变化与嗜热菌丰度的变化呈现一定的偶联关系。