【摘 要】
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背景和目的:食管鳞癌起源于食管鳞状黏膜上皮,是常见的恶性肿瘤,在我国食管鳞癌的发生率和死亡率都居世界前列。我们课题组已有来自高发区的食管鳞癌样本的全基因组测序数据,通过数据分析鉴定出了包含1,591个拷贝数扩增基因23个拷贝数扩增区段。通过整合分析94例食管鳞癌全基因组和转录组数据,发现食管鳞癌组织中有149个拷贝数扩增的基因存在异常高表达,这些基因可能与食管鳞癌有着密切的关系。因此,本课题的研究
【基金项目】
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国家杰出青年科学基金(81725015); 中国国家重点研究与发展计划(2016YFC1302701); 中国医学科学院医学与卫生技术创新项目(2016-12M-4-002,2019-12M-2-001); 北京高校卓越青年科学家计划(BJJWZYJH01201910023027);
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背景和目的:食管鳞癌起源于食管鳞状黏膜上皮,是常见的恶性肿瘤,在我国食管鳞癌的发生率和死亡率都居世界前列。我们课题组已有来自高发区的食管鳞癌样本的全基因组测序数据,通过数据分析鉴定出了包含1,591个拷贝数扩增基因23个拷贝数扩增区段。通过整合分析94例食管鳞癌全基因组和转录组数据,发现食管鳞癌组织中有149个拷贝数扩增的基因存在异常高表达,这些基因可能与食管鳞癌有着密切的关系。因此,本课题的研究目标为利用高通量功能筛选技术,从已知的149个候选基因中筛选出在食管鳞癌中拷贝数扩增且具有功能的关键基因,运用分子生物学、细胞生物学等实验策略,探讨该目的基因在食管鳞癌中发挥怎样的生物学作用以及具体的作用机制。方法:从高通量技术筛选出的候选基因中挑选目的基因VA V2,通过分析转录组测序数据,从mRNA水平上分析目的基因VA V2在食管鳞癌组织以及癌旁组织中的表达差异;通过免疫组化的方法,从蛋白水平上检测目的基因在食管鳞癌组织以及癌旁组织中的表达情况,并且比较mRNA和蛋白水平是否一致。在食管鳞癌细胞系KYSE30和KYSE150中构建稳定的VAV2敲除和过表达细胞模型。接着通过一系列体外和体内的实验,我们探索VAV2表达改变是否对对食管鳞癌细胞的增殖和侵袭转移能力产生影响。具体而言,我们通过细胞学和分子生物学实验(细胞活力检测、克隆形成、细胞侵袭/迁移、划痕、免疫印迹等),探究目的基因VAV2影响食管鳞癌细胞增殖和转移的作用机制。结果:通过高通量的功能筛选,我们发现VAV2基因是一个和食管鳞癌增殖、转移均相关的基因。在食管鳞癌细胞系中敲除VAV2抑制其表达,能降显著降低食管鳞癌细胞的增殖和迁移、侵袭能力;而过表达VAV2后则能显著促进食管鳞癌细胞的增殖和迁移、侵袭能力以及在裸鼠皮下的成瘤能力。结论:我们在食管鳞癌组织和细胞中发现VAV2拷贝数扩增且高表达,能够促进食管鳞癌细胞的增殖和侵袭转移能力,是首次在食管鳞癌中发现VAV2的促癌作用。提示深入了解VAV2在食管鳞癌发生发展过程中的生物学机制对食管鳞癌的早期诊断可能具有重要意义。
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