我国高校试办高水平运动队已走过20余年历程，取得的进步有目共睹，为国家与学校争得了一定成绩与荣誉，但在办队过程中仍然存在诸多管理冲突或矛盾，阻碍着高水平运动队的健康发展。针对这一状况，本研究运用管理协同理论，采用文献研究、访问调研与逻辑分析等方法，对我国高校高水平运动队管理协同模式进行较为深入的探讨，旨在完善高校高水平运动队的管理、促进高校竞技体育事业的发展。对我国高校高水平运动队管理现状分析表明，对照办队目标，当前高水平运动队的现实差距主要是运动成绩不能达到预期水平、顶尖体育人才招入困难、运动品牌尚未形成、为国为校争光欠佳、人才培养质量欠佳、运动队经费短缺、管理制度不规范等。进一步研究发现，高水平运动队的管理冲突可以归纳为目标定位冲突、管理权限冲突、管理部门冲突、人才选拔冲突、学习训练冲突、资源利用冲突、项目设置冲突、竞赛体系冲突和科技服务冲突等。借鉴管理协同理论进行分析，高水平运动队管理协同的要素主要有目标、项目、人员、经费、训练、竞赛、文化学习、科研、组织管理、物质条件和社会文化等，其协同机会主要有目标定位与组织管理、项目开发与项目布局、招生选拔与人才培育、经费筹措与经费利用、训练水平与比赛优胜、文化学习与训练竞赛、科技创新与科技服务、物质条件开发与合理利用、文化建设与品牌打造等。高校高水平运动队管理协同模式的主要构建依据是社会需求、教育需求、体育发展需求与管理实践需求，其基本构成涉及目标定位与组织管理协同等与上述协同机会相同的内容。高校高水平运动队管理协同模式是一个多维复杂的动态系统，其运行机制主要有管理协同的形成机制、实现机制及效应机制，其特征主要体现于科学性、完整性、目的性、非线性与动态性等五个方面。该模式的构建可为我国高校高水平运动队的建设与发展提供有益参考。