番茄表皮毛形成关键基因的图位克隆及调控机理研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jieys75001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植物表皮毛是植物表皮的一种附属结构,广泛分布于陆生植物的地上部分。表皮毛根据其构成细胞的多少可以分为单细胞表皮毛和多细胞表皮毛,根据其有无腺体可以将其分为腺体毛和非腺体毛。表皮毛不仅可以为植物提供物理抗性还可以为植物提供化学抗性。模式植物拟南芥的表皮毛为单细胞表皮毛,其形成的分子机制已经研究的较为清楚,然而茄科植物中多细胞表皮毛形成的分子机制尚不清楚。1、番茄种质资源丰富。利用180份重测序的番茄核心种质资源(包括162份表皮毛形成正常的资源和18份表皮毛缺失的资源)对调控番茄表皮毛形成的关键基因进行全基因组关联分析,结果发现在第10号染色体的末端有一个调控表皮毛形成的关键因子。与此同时,在50个已经覆盖潘那利全基因组的渐渗系(背景材料为M82)中,只有IL10-2表现为表皮毛缺失,而其它49个株系都与M82—样表现为正常的表皮毛,说明在第10号染色体的末端确实有一个调控表皮毛形成的关键因子。有趣的是,h变体LA3172的表型与IL10-2一致,也表现为表皮毛缺失。为了克隆这个关键基因,我们构建了两个F2分离群图,分别为:Ailsa Craig(AC)×IL10-2和LA3172×LA0411。对这两个群体的遗传规律分析发现,这两个材料的表皮毛缺失性状都是受一个隐性核基因调控。采用图位克隆的方法最终将目的基因定位在10号染色体59.90Mb到59.94Mb的范围内。根据番茄基因组注释,这个区间内共包含有四个开放阅读框(ORFs)。对这四个开放阅读框的gDNA全长序列进行PCR扩增发现:ORF3在LA3172和AC中具有片段长度多态性。这个结果表明ORF3极有可能为目的基因。2、在番茄现有的表皮毛缺失资源中对ORF3的多态性进行分析,共发现三种类型的突变:有的是1440 bp的缺失;有的是引起氨基酸改变的点突变;有的是单个核苷酸的缺失导致的移码突变,使得氨基酸翻译提前终止。在LA3172和LA0085中缺失1440bp,包括ORF3的全长986bp,起始密码子上游的326bp和终止密码子下游的128bp;3-605和LA0442中分别是一个核苷酸缺失导致移码突变,氨基酸翻译提前终止;在LA1589中,一共有三个氨基酸的改变,分别为69T-K、97H-N和177P-S,其中97H-N导致蛋白质不能正常折叠形成C2H2锌指;IL10-2中有七个氨基酸的突变和一个氨基酸的插入。3、将ORF3在h突变体LA3172中表达能够恢复突变体表皮毛缺失的表型;对其背景材料AC中ORF3的表达进行干涉能够抑制表皮毛的形成。这一结果表明:ORF3即为H丑基因。4、对LA3172和IL10-2及其背景材料的表皮毛进行扫描电镜观察发现:LA3172和IL10-2的茎表皮I型腺体毛完全消失。表明H基因在I型腺体毛的形成过程中发挥重要的作用。5、对H基因在AC的根、幼茎、成熟茎、茎表皮、成熟叶、幼叶、花和果等各组织中的表达量进行分析发现,H基因在各个组织中均有表达,在花和果实中的表达量明显比较高。说明H基因不仅在腺体毛的形成过程中起重要的作用,而且在花和果实发育的过程中也具有重要的作用。6、H开基因在烟草中超量表达可以使烟草表皮毛的密度显著增加。与此同时烟草中H基因的同源基因ZFP8(Niben10ISc00749g00003.1)和辣椒中H孖基因的同源基因CA10g21340在番茄中超量表达也能够促进表皮毛的生成。这个结果表明H基因在进化的过程中在茄科物种中的功能是比较保守的,都能够调控表皮毛的形成。7、双突变体(Wo_hh)和h突变体都没有I型腺体毛的形成,说明h基因对的Wo具有隐性上位效应。在h突变体LA3172中,Wo基因的表达量没有变化,但是在Wo突变体LA3186中H基因的表达量上升,在Wo涉材料中H基因的表达量降低,说明Wo正调控H基因的表达。通过酵母双杂交和GST-pull down表明,H通过与Wo互作来调控I型腺体毛的形成。8、番茄dl突变体LA3724的表皮毛数量减少、长度变短。扫描电镜观察发现,LA3724的表皮毛并不是一串垂直于表皮的细胞,而是有的是分叉的表皮毛,有的是颈部为两列平行的细胞。此外LA3724的花药不能连接在一起形成一个典型的花药筒导致LA3724的座果率显著降低。根据番茄高密度遗传连锁图谱,dl基因被定位在八号染色体,因此我们以LA3724为母本,IL8-1和LA1589为父本分别杂交构建两个F2分离群体对dl基因进行精细定位。最终将dl成基因定位在八号染色体的52.81Mb到52.92Mb这109Kb的范围内。根据番茄基因组注释,这个区间内有7个ORFs。对这7个ORFs的编码区序列进行测序,在两个亲本之间没有发现差异。然而对这7个ORFs的表达量进行分析发现,ORF7编码一个水通道蛋白,其表达量在突变体材料中显著上升。这个结果表明ORF7极有可能就是dl基因的候选基因。
其他文献
目的探讨网络教育结合翻转课堂在护理在职培训中的应用。方法选取我院2015年2月~2016年3月的护理人员147例,依据培训模式不同分为观察组(n=75)与对照组(n=72),对照组采取传统
文章介绍了最新发布的T/CPCA-4405-2020《印制板用硬质合金铣刀通用规范》的制定背景、制定过程、制定要点及该标准的意义。
对安康市汉滨区核桃产业发展现状及特点进行全面调查和分析,并针对其发展中存在的问题,提出发展对策,以促进安康市汉滨区核桃产业的持续健康发展。
随着网络技术的日益推广和普及,网络与民事主体的关系将越来越密切,没有法律规范的网络与电子商务是难以正常发展的,及时制定并出台相应的法律法规.鼓励、引导、维护网络与
目的观察阿加曲班抗凝治疗发病48 h内的急性脑梗死的疗效。方法收集2014年1月~2015年10月我院神经内科收治的发病48 h内的急性脑梗死患者。根据是否使用阿加曲班治疗分组,使
目的:利用Meta分析的方法探讨中国已婚妇女宫颈癌发病相关因素。方法:依据询证医学要求对相关医学数据库进行全面检索,将中国已婚妇女宫颈癌的病例对照研究筛选出来,对纳入研究
我国中小学校长的领导职责与评价研究一直存在缺乏专业依据、指标体系不明确、重显绩轻潜质等诸多问题,已严重阻碍新世纪校长的专业发展。从校长的专业立场来看,校长应有六大
在当前新冠病毒(COVID-19)阻碍了今年行业春季论坛会的相聚交流,而纸质媒体和网络媒体使技术交流继续保持旺火。本刊《印制电路信息》在广大同行的支持下,多年来有许多优秀论
设计了一种基于分子信标的新型生物检测模型,以上转化发光纳米粒子(UCPs)作为FRET 能量供体,利用分子信标茎环结构的优势,有效减小供受体之间距离,从而增加FRET 能量转移效率,
0前言印制电路板(PCB)的设计和制造工艺要求越来越高,其产品也从简单结构(双面板、多层板)向HDI(高密度互连板)、高层电路板(10层或以上)等高端PCB产品发展。由于PCB层数越来