禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae)和菲利普孢囊线虫(H.filipjevi)是我国麦类作物的重要病原线虫,可造成小麦产量的严重损失。H.avenae在我国16个省市区的麦区有发生分布,而H.fillpjevi目前在河南和安徽两省有分布,此外,二者在河南省复合侵染小麦的现象比较普遍。本研究建立同步快速检测这两种孢囊线虫的双重PCR体系,旨在为我国小麦孢囊线虫(CCN)的田间快速诊断与综合治理提供技术支持;此外,通过挖掘GenBank中EST数据信息开发H.avenae的微卫星(SSR)标记引物,旨在为揭示我国CCN不同地理种群的遗传结构和多样性以及种群扩散传播途径提供理论支持。主要研究结果如下:1.基于mtDNA-COI序列建立H.avenae和H.filipjevi的双重PCR检测体系通过比对分析10种植物寄生线虫24个群体的mtDNA-COI序列,设计并筛选出H.avenae特异性上游引物HaF8和H.filipjevi特异性上游引物HfF9,以及二者的下游通用引物HafR8。引物对HaF8/HafR8对H.avenae的扩增产物为200 bp,而HfF9/HafR8对H.filipjevi的扩增产物为320 bp,条带区分明显。建立了针对两种CCN的双重PCR检测体系,在优化的退火温度58℃和引物HaF8/HfF9/HafR8浓度比0.24:0.16:0.4 μmol/L时,能从不同供试线虫中同时特异检测出H.avenae和H.filipjevi,扩增效率较高;对H.avenae和H.filipjevi单孢囊的检测灵敏度为1/2000000个孢囊,而对2龄幼虫的检测灵敏度则分别为1/640条线虫和1/1280条线虫。对我国黄淮麦区14个CCN样本的鉴定结果表明,该检测体系可用于H.avenae和H.filipjevi田间单一或混合发生样本的同步快速检测。2.基于EST数据库开发H.avenae的SSR标记通过挖掘GenBank中EST数据信息开发微卫星(SSR)标记引物是最为经济高效的策略。本研究基于H.avenae的EST序列设计了 210对SSR标记引物,通过降落PCR和短串联重复(STR)分型检测,共筛选到13对多态性较好的SSR标记引物。利用H.avenae群体JSPX对这13对SSR引物进行多态性分析,发现CS-31、CS-60、CS-102、CS-121、CS-137、CS-179、CS-187 和 CS-8384 等 8 对 SSR标记引物所对应的微卫星位点,无效等位基因频率都很低,低至为0,多态性信息含量(PIC值)均大于0.25,表明它们的多态性较高。此外测试13对SSR引物的哈德温(Hardy-Weinberg)平衡和连锁遗传,并利用Sequencial Bonferroni校正P值,发现以上8对SSR引物均未偏离哈德温平衡(P<0.05),也不存在连锁遗传现象(P<0.05)。结果表明,这8对SSR标记引物具有良好的多态性,可用于分析我国H.avenae.不同地理群体的遗传结构和多样性。