论文部分内容阅读
发酵乳杆菌(Lactobacillus fermentum)作为常用的发酵剂菌种,常适用于发酵食品的生产和贮藏,对其风味的改善及保质期的延长极其重要。本研究以分离自蒙古国的发酵乳制品(69株)及中国的7个省市的发酵乳制品(73株)和酸粥(60株)的共202株发酵乳杆菌为研究对象,结合参考菌株L.fermentum IFO 3956的全基因组序列,采用多位点序列分型技术(Multilocus Sequencing Typing,MLST),基于 11 个看家基因 clpX、dnaA、dnaK、groEL、murC、murE、pepX、pyrG、recA、rpoB和uvrC构建MLST方案,对发酵乳杆菌的遗传多样性进行分型研究,进而解析菌株间的亲缘关系和进化历程,从基因水平上为发酵乳杆菌的准确鉴定和工业上食品发酵剂的筛选提供参考。试验结果如下:(1)203株发酵乳杆菌共分为57个ST型,其中27株菌属于独立的序列型。(2)经eBURST分析,57个ST型组成了 5个克隆复合体,分别为CC1、CC2、CC3、CC4和CC5及34个独特型,在CC1中ST4包含最多分离株(46株),处于中心位置,被认为是祖先序列型。(3)LIAN连接分析结果显示发酵乳杆菌菌群存在连锁不平衡(IAS=0.2142)。分裂分解图分析结果表明发酵乳杆菌菌株在进化过程中由于重组导致了基因多样性的增加。(4)基于11个看家基因联合序列的系统发育树分析表明,57个ST型被分为两个主要类群:A类群由78株菌组成,归属于33个ST型,大部分离株(73%)分离自酸粥样品;B类群共包含24个ST型(125株),95%的分离株分离自不同发酵乳制品。结果表明:同一类群中的发酵乳杆菌分离株进化关系较近。(5)最小生成树分析结果表明发酵乳杆菌进化分型与分离源有一定的相关性,并发现分离自发酵乳制品和酸粥的分离株可能来源于共同的祖先。