红树林是热带和亚热带海岸潮间带特有的植物群落，其内部蕴藏着丰富的微生物资源，从而逐渐成为天然产物化学家关注的热点。　　 本论文主要分成两个部分，第一部分综述了海洋微生物次级代谢产物的最新研究进展，第二部分分别对三株南海红树林内生真菌(ZH-151、SK6RN3M、5G1＃)的次级代谢产物进行化学成分研究。应用现代波谱技术，如IR，UV，MS和NMR等鉴定了分离得到的十九个化合物的结构，其中三个为新化合物。利用X-ray(CuKα)衍射确定了新化合物2-1的绝对构型，同时研究了部分代谢产物的抗肿瘤活性及抗菌活性。　　 从红树林内生真菌ZH-151中分离得到两个新化合物(2-1、2-2)和五个已知化合物，其中化合物2-1对绿脓杆菌具有很好的抑制活性，MIC=6.25μg/mL。化合物2-3对口腔癌细胞株KB和多药耐药性口腔癌细胞株KBv200有中等活性，IC50值分别为20.38±1.13和16.06±1.58μg/mL。五个已知化合物为：3-异丁基哌嗪-2，5-二酮、麦角甾醇、过氧麦角甾醇、胸腺嘧啶和甘露醇。　　 从真菌SK6RN3M中分离得到一个新化合物3-1和四个已知的蒽醌类化合物：大黄素、大黄素甲醚、1,4-dihydroxy-2-methylanthracene-9,10-dione和丁二酸。新化合物3-1在体外显示了中等的抗肿瘤活性，其抑制KB和KBv200肿瘤细胞株的IC50值分别为20.4和16.1μg/mL，同时对绿脓杆菌有较好的抑制活性，MIC值为12.5μg/mL。　　 从菌株5G1＃中分离得到五个已知化合物：Bacillosporin C、griseoxanthone C、麦角甾-7，22(E)-二烯-3β，5α，6β-三醇、环(甘-苯丙)二肽和环(苯丙-酪)二肽。其中Bacillosporin C是一个结构奇特的化合物，其体外细胞毒活性值得进一步去研究。