在市场经济冲击的浪潮下，一切以市场为导向，各行各业都以盈利为目的、实现价值最大化，时下国内外生化行业竞争激烈，产能过剩、成本高，价格低迷，转变经营模式，转变研发项目管理方式，在市场、行业、企业等多重因素制约条件下，结合企业自身研发项目管理的现状，针对性地采取一系列创新措施，有效地配置人、财、物资源，提高研发新产品，新工艺技术的质量，增加经济效益，提高企业核心竞争力，提高研发能力，促使研发项目管理发挥最佳效力，为企业健康，持续发展打下坚实根基。　　本文从ZL公司研发项目管理的现状着手，分析其影响研发效能的关键制约因素。然后成功地将阿米巴经营理念引入研发项目管理中，重新策划了研发项目管理体系。在新的体系下，分别对组织结构、流程进行了优化、设计，降低了管理成本，实现了流程控制过程中，多阶段项目评审、诊断，缩短项目生命周期，控制成本最小化，创造价值最大化。其次，详细阐述阿米巴经营应用于研发项目核算制及绩效衡量方法的建立。最后，提出了阿米巴项目管理的团队建设方法，从阿米巴文化的传播、领导人的培养方式及激励机制的建立方面，详细阐述并指出了阿米巴经营理论在研发项目管理中应用策略和方法，实现了全体员工共同参与经营管理，复合型人才的快速培养。整体提高了ZL公司研发项目管理的水平。值得同类企业借鉴和参考，同时希望本文的研究内容，能够在实际研发项目管理应用过程中，凸显出实用性，创造出重要价值成果。