【摘 要】
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本研究以牦牛瘤胃微生物总DNA为试验材料,使用16S rRNA基因序列分析技术研究全国主产区牦牛瘤胃细菌多样性,对之进行比较。依次为基础并对青海放牧牦牛与舍饲牦牛瘤胃细菌多
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本研究以牦牛瘤胃微生物总DNA为试验材料,使用16S rRNA基因序列分析技术研究全国主产区牦牛瘤胃细菌多样性,对之进行比较。依次为基础并对青海放牧牦牛与舍饲牦牛瘤胃细菌多样性进行了比较,结果如下:1、本研究采用三种方法提取牦牛瘤胃微生物总DNA,结果发现三种提取方法都能提取到较为完整且片段较长的DNA,提取的DNA都能满足后续试验的要求,但液氮研磨法-CTAB/SDS/蛋白酶K法提取的DNA最优(纯度:1.83,浓度:99.1)。2、对青海省河南县、青海省大通县、青海省刚察县、甘肃省甘南碌曲、四川省红原县、云南省迪庆、新疆巴州全放牧牦牛瘤胃细菌多样性进行了16S rRNA基因序列分析,发现放牧牦牛瘤胃内细菌主要分为两大类:Firmicutes类和Bacteroidetes类,以Firmicutes类所占比例较高。不同地区牦牛瘤胃内Firmicutes类所占比例大小顺序为:青海省河南县牦牛(79.52%)>青海省刚察县牦牛(77.42%)>云南省迪庆牦牛(73.45%)>新疆巴州牦牛(69.52%)>青海省大通县牦牛(62.65%)>四川省红原县牦牛(62.63%)>甘肃省甘南碌曲牦牛(61.95%);不同地区牦牛瘤胃内Bacteroidetes类所占比例大小顺序为:青海省大通县牦牛(28.92%)>四川省红原县牦牛(27.27%)>甘肃省甘南碌曲牦牛(24.78%)>新疆巴州牦牛(23.81%)>青海省河南县牦牛(19.27%)>青海省刚察县牦牛(15.05%)>云南省迪庆牦牛(15.04%)。3、而且研究发现,放牧牦牛瘤胃纤维降解菌主要属于Firmicutes(LGCGPB)类。而且研究发现纤维降解菌是放牧牦牛瘤胃内的优势菌群,其中以溶纤维丁酸弧菌和黄色瘤胃球菌最具有优势。除青海省刚察县牦牛瘤胃内检测到1个OTU属于白色瘤胃球菌外,其它地区牦牛瘤胃内都未检测到白色瘤胃球菌。通过16S rRNA基因序列分析技术构建了不同地区牦牛瘤胃细菌16S rRNA基因克隆文库。4、在此基础上,对舍饲和放牧牦牛瘤胃细菌多样性进行比较发现,舍饲牦牛瘤胃细菌也主要分为两大类:Firmicutes类和Bacteroidetes类。放牧牦牛瘤胃Firmicutes类所占比例(79.52%)比之舍饲牦牛瘤胃Firmicutes类所占比例(62.79%)要高,Bacteroidetes类在瘤胃内所占比例放牧牦牛(19.27%)比之舍饲牦牛(25.58%)要低。舍饲牦牛瘤胃内比之放牧牦牛瘤胃内的蛋白降解菌和淀粉降解菌更丰富。
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