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棉花在国民经济中具有重要地位，是我国仅次于粮食作物的第二大农作物，其中转基因抗虫棉在国内的种植面积已占棉花总种植面积的70%以上，并有持续增长的趋势。棉花是纤维研究的模式植物，但与拟南芥、水稻等模式植物相比，其在蛋白质组学、基因组学、生理学和遗传学等方面的研究较薄弱。棉花蛋白质组学研究起步较晚，双向电泳图谱库和蛋白质组数据库均有待完善；且目前棉花蛋白质组学研究主要集中在纤维发育机制、胁迫反应等方面，有关棉花发育期的蛋白质组学研究在国内外鲜有报道。本研究以转cry1Ab基因抗虫棉（07-19和