长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是参与基因表达调控的新型分子,其表达异常是导致癌症发生的重要因素。CRNDE(Colorectal Neoplasia Differentially Expressed)是具有 12 种选择性剪接体的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),目前的研究提示其异常表达可能与癌症的发病机制有关。然而,CRNDE的表达失调是否在癌症中常见,以及在癌症中的功能仍不清楚。在本研究中,我们首先分析了正常人类样本中CRNDE的表达情况,发现CRNDE的表达具有组织和细胞特异性。进一步比较了来自15种实体瘤和造血系统肿瘤的2,938例病人样本表达谱数据,表明CRNDE在11种癌症类型中显著高表达,其中包括3种已报道的和8种未报道的癌症,并提示在CRNDE不同转录本在肿瘤中表达有差异。特定抗癌药物作用癌症细胞系和病人样本,可有效纠正CRNDE特异性转录本的异常表达。进一步,通过qRT-PCR实验验证了 12种CRNDE可变剪接体在肿瘤细胞系中的表达情况,发现CRNDE-g剪接体在所检测的多种癌细胞中是表达最高的。以上结果说明高表达的CRNDE及其特异性的可变剪接体在癌症中发挥着潜在的癌基因特性。进一步,我们研究CRNDE在造血系统肿瘤急性髓细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)不同亚型中的表达模式。通过比较表达谱数据,发现CRNDE在急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)中特异性高表达。同时,我们还发现188个APL特征性的lncRNA,其中125个特异性上调和63个特异性下调。进一步GSEA分析发现特异性上调的lncRNA在全反式维甲酸(all-trans retinoid acid,ATRA)处理后,能够显著富集于ATRA下调的基因集中。qRT-PCR实验证实CRNDE在APL细胞系NB4细胞中能够被ATRA抑制且具有时间依赖性。功能研究发现,敲低CRNDE能够促进NB4细胞的分化,并且增加ATRA诱导的细胞分化。RNA-seq分析表明敲低CRNDE能够影响一群髓系分化相关基因的表达。综上所述,本研究系统地诠释了高表达的CRNDE及其特异性的可变剪接体与多种恶性肿瘤发生密切相关,尤其揭示了CRNDE在APL中抑制造血分化的致病机制,为药物治疗提供靶点。