12例高级别浆液性卵巢癌患者WES数据分析

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sprock
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:卵巢癌是女性生殖系统常见的恶性肿瘤之一,发病率仅次于宫颈癌和子宫内膜癌。高级别浆液性卵巢癌是卵巢上皮性癌中最常见的一种,恶性程度较高,容易出现转移,大多数患者就诊时已属晚期。目前卵巢癌的主要治疗手段是手术和化疗,也有部分患者可获益于靶向治疗。本文利用全外显子测序分析12例高级别浆液性卵巢癌的突变特征,寻找可能发生突变的抑癌基因和驱动基因,为寻找高级别浆液性卵巢癌的新治疗靶点打下基础。方法:从12例高级别浆液性卵巢癌患者获得手术组织。从冰冻组织中提取基因组DNA。使用Agilent Sure Select XT Human All Exon v6捕获基因组的外显子区域。使用Illumina NovaSeq 6000对捕获的外显子区域进行测序。通过BBTools对下机数据进行过滤。使用BWA将clean data比对到参考基因组上。使用Mutect2检测样本中的变异。通过ANNOVAR对检测到的变异进行注释。使用VarElect筛选可能突变的抑癌基因。通过maftools分析可能的驱动基因,并对数据进行可视化。结果:1.抑癌基因分析在12例高级别浆液性卵巢癌样本中找到3个高频突变的抑癌基因,其中TP53在9例样本中突变,BRCA1和PTPRT在2例样本中突变。2.潜在驱动基因分析在12例高级别浆液性卵巢癌样本中找到34个潜在的驱动基因,分布于7个和肿瘤密切相关的信号通路中。结论:本研究通过对12例高级别浆液性卵巢癌患者的WES数据进行生物信息学分析,得到了重要的抑癌基因突变信息,筛选出了可能存在的驱动基因,对高级别浆液性卵巢癌有了更为深入的认识,并为进一步理解高级别浆液性卵巢癌的发病机理打下了基础。最重要的是,也为进一步寻找高级别浆液性卵巢癌的潜在治疗靶点提供了一定的理论依据。
其他文献
金融支农是促进农业经济发展、农民增收的重要措施之一。但是随着农业经济发展,化肥、农药、农膜等生产要素的过度投入,导致了农业生态环境污染、粮食安全和温室效应等一系列
随着电子商务行业的不断发展,网络购物已经在人们日常生活的消费模式中占据了十分重要的地位。据CNNIC第44次《中国互联网络发展状况统计报告》,截至2019年6月,我国网络购物用户占网民总体比例为74.8%,网络购物早已成为一种不可避免的潮流。在这一背景下,研究网络消费者的购买行为就显得尤为重要。在线评论是消费者获取参考信息的重要来源,由于它真实记录消费者对商品的印象和感受,其包含的信息会对消费者的
普京上任之初针对俄罗斯面临的严峻形势,对新世纪俄罗斯军事战略的若干重大理论和现实问题做出了新的回答。特别是伊拉克战争的爆发,加速了俄罗斯军事战略调整的步伐。以2003
科学技术的进步,推动全球经济的发展,人们物质生活水平得到了极大的提高,越来越多的人选择创业来实现自我的人生价值。因此,创业能力的培养也越来越受到学者们的关注,越来越
本文试图立足于中国近代思想史的角度,从《国画月刊》的立场宗旨出发切入研究,运用美术史、社会学、统计学等研究方法结合文本中出现的如“国画”、“法度”、“风景画”等的
为了研究臭氧-曝气生物滤池二级处理出水深度处理组合工艺的处理效果,采用臭氧-曝气生物滤池(biologi-cal aerated filter,BAF)组合工艺对城市污水处理厂二级生化处理出水进
在司法实践中存在着对于诈骗罪与合同诈骗罪认定的困惑,所以本文将在理论和实践两个方面对诈骗罪与合同诈骗罪进行辨析。
以东莞地区某典型印染企业尾水为研究对象,针对东江流域饮用水源河流水质污染现状及纳污河流水质改善目标要求与企业对尾水回用的实际需求,进行了印染废水深度处理回用工艺的适
初中生美术学业成就评价不仅是综合素质评定的重要组成部分之一,也是美术教育评价不可缺少的内容。本文对浙江省杭州市余杭区初中生美术学业成就评价的内容、标准、方式、过程
将56例肝癌患者辨证分为肝郁脾虚、气滞血瘀、湿热蕴结、肝肾阴虚等证型,然后结合病灶的CT扫描,分析得出各证型的影像表现。以此为肝癌辨证分型提供新的依据,并指导临床诊疗