从新近报道的抗疟药物作用受体PfATP6出发,利用计算机辅助药物设计的方法对40个青蒿素衍生物、43个螺金刚烷臭氧化物分别进行了三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,主要进行了以下工作:研究了40个青蒿素衍生物的结构—活性关系,利用分子对接技术(FlexX)和比较分子力场分析(CoMFA)方法建立了两个CoMFA 3D-QSAR模型,分别是基于对接的Docking CoMFA模型和基于传统叠合方式的Database Align CoMFA模型;通过PLS数理统计分析,发现Docking CoMFA模型在分析药物构效关系、预测化合物活性方面有更好的表现;对立体场和静电场进行分析指出,在青蒿素分子C13位连接空间体积较大的基团、在C14位连接体积较小基团以及在O15位连接电负性大的基团、在C14位连接电负性小的取代基都有利于提高化合物的抗疟活性。研究了青蒿素衍生物与受体PfATP6的对接情况,发现青蒿素衍生物B,C环的侧链可以与受体表面的氨基酸残基发生疏水相互作用,从而对配基—受体的结合产生影响。另外,衍生物分子中过氧键上的一个氧与PfATP6上氨基酸残基Ile1041上的氢之间形成了氢键,提高了配体—受体复合物的稳定性。采用模拟退火优化方法和对接叠合方式对43个螺金刚烷臭氧化物建立CoMFA模型。由于这类物质分子中可变结构差别太大,缺乏共性且每类结构中分子个数都较少,因此没有得到理想的CoMFA模型。今后可通过对该类型化合物进行二级分类,以及增加分子的个数来建立CoMFA模型,研究该类型化合物的结构—活性关系。