发展中国家通常存在着传统部门和现代部门、经济发达地区和落后地区相并存的双重二元经济结构。促进二元经济结构顺利转换是发展中国家经济发展的关键问题。金融是现代经济的核心,在一国经济发展中发挥十分重要的作用。金融结构的变化必然对二元经济结构转换产生影响。然而既有的金融结构理论、二元经济结构理论对金融结构与二元经济结构转换的关系并没有太多的关注。从现实来看,我国的双重二元经济结构特征比较明显,已经成为影响我国经济长期发展的一个“瓶颈性”因素,完善金融结构促进二元经济结构转换是实现我国经济发展、构建和谐社会的内在要求。因此,系统而又深入地研究二元经济结构转换中的金融结构问题具有重要的理论价值与现实意义。本文在继承前人研究成果的基础上构建了金融结构与二元经济结构转换内在机理的理论分析框架。其内在逻辑是:金融结构的变化影响金融系统各项功能的发挥,金融功能的发挥与提升通过作用于资本积累、技术进步与金融资源在两部门之间的配置三个方面,促进二元经济结构的转换。在此基础上,拓展了“金融中介两部门模型”,进一步从数理上阐释金融结构与二元经济结构转换之间的内在关联性。基于我国双重二元经济转换的现实背景,从空间层面与产业部门层面对金融结构进行了分析。就金融空间结构而言,本文建立了金融地理学视角下的分析框架。空间差异是金融空间结构的静态分析,着眼于金融空间结构的分布状态;空间过程旨在描绘金融空间结构的动态演进;空间的相互作用则强调金融空间结构的协调和优化。依次来看,我国金融空间结构分布状态是过度非均衡的;金融空间结构演进在多种因素共同作用下表现出与理论分析迥异的特征;金融空间结构是不协调的。金融空间结构与地理二元经济结构关系的实证研究进一步表明,这种不合理、不协调的金融空间结构使得金融功能没有很好地发挥,金融资源空间配置效率低下,对地理二元经济结构转换产生了负面影响。就金融配置结构而言,两部门之间的金融资源配置严重失衡,具体表现在:非农业部门金融资源配置获得倾斜支持,而农业部门金融资源配置不足且缺乏效率。在影响金融配置结构的因素中,政府行为起到了主导作用,市场机制的作用逐步加强,发展战略的影响由强减弱,产业特征和金融生态环境有重要影响。金融配置结构与部门二元经济结构关系的实证研究表明,这种不合理的金融配置结构使得金融功能没有很好地发挥,金融资源产业配置效率低下,对部门二元经济结构转换产生了负面影响。进一步看,当前问题的关键主要是由于农业部门存在严重的金融抑制与金融排斥。要加快促进双重二元经济结构的转换,就必须在注重金融总量扩张的同时,完善金融空间结构与配置结构,实现金融资源在地区之间、部门之间的协调配置。在完善金融空间结构的思路上,要合理定位政府行为与市场机制的关系,完善地方中小金融机构体系和区域资本市场体系,设立区域性政策性金融机构,实行适度倾斜的差异化金融政策,优化区域金融生态环境。在完善金融配置结构的思路上,要建立覆盖城乡的普惠性社区银行体系,积极培育和发展资本市场,对农业部门实行金融约束政策,农业金融机构走外生性供给与内生性发育并重的发展路径;完善金融支持农业部门的调控机制、激励约束机制,优化农村金融生态环境。