蜱源LCMV的鉴定和全基因组序列分析

来源 :吉林农业大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:chu74042828
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蜱是非常重要的媒介节肢动物,其种类丰富、分布广泛,可传播多种人畜共患疾病,危害极大。我国东北地区常见蜱传病包括莱姆病、巴贝斯虫病、立克次体斑点热、森林脑炎、发热伴血小板综合征等。大多数蜱媒传染病临床症状不典型,在临床上易被误诊和漏诊。蜱传病现已成为传染病科研热点之一。随着分子生物学技术的不断进步和统计方法的不断完善,蜱传病原的鉴别与临床诊断水平获得了长足的提升。淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒(lymphocytic choriomeningitis virus,LCMV),属于单股负链RNA病毒目,沙粒病毒科,沙粒病毒属病毒,也是沙粒病毒科最早被发现的病毒。其自然宿主为啮齿类动物,疾病感染途径包括与啮齿类动物接触,被啮齿类动物叮咬和被携带病毒的节肢类动物叮咬。LCMV感染人后可引发无症状的持续性感染,严重的会引发脑膜炎致死,免疫力缺陷病人感染该病毒后致死率更高。20世纪70年代,曾有报道65名病人感染慢性淋巴细胞脑膜炎,原因疑似为蜱叮咬传播。近50年来无蜱携带LCMV报道。本研究于2015年4月在吉林省敦化市和珲春市敬信镇采集蜱样品,将采集蜱样品依据蜱种和地区分组,进行宏病毒基因组测序,发现吉林地区的蜱虫携带有LCMV。因此,我们对吉林省的蜱样本携带LCMV的情况进行了流行病学研究。我们分别对四种蜱样品携带的LCMV进行了全基因组扩增,并进行了序列进化分析。经统计,本次采集534只蜱,共包含4个种,其中:草原革蜱43%,森林革蜱38.3%,长角血蜱11.4%,全沟硬蜱7.1%。吉林省蜱携带LCMV总体阳性率为3.5%,其中敬信镇和敦化市阳性率分别为:5.6%和1.5%。长角血蜱、草原革蜱、森林革蜱和全沟硬蜱阳性率分别为12.2%,2.5%,4.4%和2.5%。对吉林地区蜱携带的LCMV进行全基因序列分析,发现其S片段和L片段与Ⅰ型LCMV核苷酸同源性最高分别为86%和82.2%,与Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型LCMV同源性较低。系统进化树分析表明四种蜱携带的LCMV均为Ⅰ型LCMV,且处于系统发育树的一个单独的分支中。本实验首次对我国蜱携带的LCMV进行了阳性率调查,发现吉林省敦化市和珲春市敬信镇共有4种蜱携带LCMV,长角血蜱感染率最高。通过对LCMV全基因组的遗传进化分析,发现四种蜱携带的LCMV均为与人类严重疾病相关的Ⅰ型LCMV,提示蜱可能是LCMV的传播媒介。本研究确定了东北地区蜱LCMV阳性率及基因型,为LCMV的防控监测提供科学依据。
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