两种信息可视化工具在学科知识领域应用的比较研究——人胚胎干细胞文献分析

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前言信息爆炸时代的到来促使了信息可视化这一崭新科学领域的出现,将信息可视化与文献计量学相结合生成各知识领域的可视化图谱是近年来的一个研究热点,研究人员经常用到Histcite和Citespace对学科领域进行可视化研究。本文以人胚胎干细胞研究为例对Histcite、Citespace的易用性及二者形成的可视化图谱进行比较分析,总结出各软件的优点、缺点,以便在今后的可视化研究中扬长避短,更好的发挥各个软件的作用,并为以后国产可视化软件的开发提供有益参考,同时分析人胚胎干细胞研究的前沿演进过程。资料与方法从Web of Science上检索并下载人胚胎干细胞文献,分别导入Histcite和Citespace。对于Histcite,分别按年代、期刊、作者、主题等方面对人胚胎干细胞文献进行统计,选取被引次数最高的65篇文献生成可视化引文编年图,将图保存为“胚胎干细胞“.net”格式文件,并将“.net”文件导入Pajek描绘该领域的主要路径图。对于Citespace,人胚胎干细胞的文献共被引分析的设置阈值:(6,5,22)(22,12,25)(28,14,32),并对时间跨度、节点类型、术语来源、术语选择等选项进行选择;人胚胎干细胞前沿演进可视化图谱的制作:对检测出的1779个突现词进行共现分析,阈值设置为(4,4,8)、(18,10,10)、(24,12,12),同时选择"pathfinder"对网络进行精简,并选择按时区显示及合并显示网络。对合并网络分别进行Spotlight、timezone操作显示关键突现词之间的关键路径和突现词的时区分布。结果运用Histcite产生的结果:人胚胎干细胞文献的概述(年代、期刊、作者、机构、引文)、篇名词分布,并得到人胚胎干细胞研究文献引文编年图和其主要路径图;运用Citespace获得含有10各关键节点的人胚胎干细胞共被引网络聚类图和突现词混合网络图8个,并得到总体突现词网络图的"spotlight"及"timezone"图。结论Histcite的优点:界面简洁,使用简便,可使文献计量学统计工作变得轻易快捷;可视化作图时参数设置简便,产生的引文编年图可显示某领域内的关键事件,主要路径图可以使研究者快速了解该领域内各个年代的重要文献。Citespace的优点:来源数据可多元化;多种参数设置方式;可对图谱进行精简;不需借助其他工具即可显示关键节点;产生的彩色图谱容易解读,可进行交互操作,多种方式显示各种类型的共引/共现及前沿演变图谱。人胚胎干细胞研究的前沿演进过程:1990-1997年:胚胎干细胞分离、培养、建系、分化抑制、胚胎发育、基因表达等;1998-2005年:(人)胚胎干细胞的多能性的维持、基因表达、定向分化诱导成特定类型的细胞及组织工程、再生医学成为这一时期的前沿主题;2008-2009年:(诱导)多能干细胞、再生医学、治疗应用。
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