软件水印是一种解决软件版权保护的技术。传统的软件水印技术面临防篡改能力有限,水印嵌入的数据率、鲁棒性较低等问题。本文围绕软件水印在版权保护中所关注的上述问题,从软件盗版、软件篡改和逆向工程等攻击出发,结合静态分析、软件水印和代码加密技术,来提高软件水印的数据率、鲁棒性和防篡改能力,增强软件水印的版权证明能力。论文通过比较静态水印与动态水印,深入研究了水印数据的分割算法、动态图软件水印的水印拓扑图结构、水印的嵌入与提取过程等。在此基础上,给出了改进的水印拓扑图结构,同时提出了“软件水印+代码加密”的软件保护方案,通过原型系统及实验数据验证了该方案的可行性和有效性。具体研究工作主要包括：(1)围绕动态图水印中的水印拓扑图结构进行研究。针对抗攻击性最好,但是数据率较低的PPCT结构,提出一种改进的MPPCT结构,并将其与PPCT结构进行比较分析,结果表明MPPCT结构在数据率方面具有明显优势,且能有效抵抗共谋攻击,是一种良好的水印拓扑图结构。(2)为了增强软件水印的鲁棒性及防篡改能力,提出一种基于代码加密的防篡改软件水印方案。水印嵌入过程中,使用基于广义中国剩余定理的数据分割法,对代表版权信息的大数进行分割,以提高水印信息的隐蔽性。通过修改软件的源代码和目标代码实现水印的嵌入过程,根据特定的策略对部分目标代码进行加密,并提高加解密密钥与程序自身的关联聚合度,从而增强软件水印的鲁棒性以及防篡改能力。(3)设计并开发了原型系统——MPPCTMark.结合水印生命周期,使用一个具体应用实例来阐述系统的整体工作流程。针对软件水印的数据率、隐蔽性、鲁棒性、安全性以及给程序带来的性能过载等评价指标,对MPPCTMark进行大量实验,实验数据和结果充分表明了本文中水印方案的有效性、健壮性和可行性。