随着测序技术的不断发展,越来越多物种基因组被测序,从而产生了海量的可利用数据。本研究就建立在此基础上,利用生物信息学手段,对还未有完整线粒体基因组信息的物种进行线粒体基因组测定。本论文中测定了黑猩猩和东部低地大猩猩的线粒体基因组序列,比较分析了两种猩猩线粒体基因组,两种猩猩的线粒体基因组均包括了37个基因：13个蛋白质编码基因(PCGs),2个核糖体RNA基因(rRNA)以及22个转运RNA基因(tRNA),与其他已测定的猩猩的线粒体基因组特征一致。本研究分别计算了黑猩猩和东部低地大猩猩每个蛋白质编码基因间的核苷酸序列和氨基酸序列差异,结果显示,两种猩猩蛋白质编码基因序列存在明显差异,可以作为区分黑猩猩和东部低地大猩猩重要的分子依据。本研究中,细胞色素氧化酶c基因(COXl, COX2, COX3)和ND4L基因的突变率低于NADH脱氢酶基因(ND1、ND2、ND3、ND4、ND5和ND6),这一结果前人的研究结果是一致,并与之前发表的几种近缘物种的线粒体基因组进行了比较,利用线粒体基因组的核苷酸序列和及其编码的氨基酸序列对人科动物的系统发育关系进行了探讨。