超级转录延伸复合物组分AFF1在肺癌中对趋化因子的调控

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真核生物的转录过程在生物个体发育以及疾病发生中具有举足轻重的地位。RNA聚合酶Ⅱ(pol Ⅱ)负责mRNA的初步合成。目前的研究表明pol Ⅱ不能独立起始转录,在一些情况中pol Ⅱ与通用转录因子结合后会停留在转录起始位点附近,等待合适的信号输入后,在正性转录因子(P-TEFb)的作用下磷酸化pol Ⅱ的羧基末端,被激活的pol Ⅱ将继续行使转录功能。这种模式被称为转录延伸检查点调控(Transcriptional Elongation Checkpoint Control,TECC)。超级延伸复合物(Super Elongation Complex,SEC)在这一步中发挥了重要作用,该复合物主要包括转录延伸因子ELL蛋白,正性转录延伸因子P-TEFb以及几种混合白血病易位伴侣蛋白,例如AFF1,AFF4,ENL和AF9。SEC与发育及癌症发生具有密切联系,以往的研究表明SEC中的AFF1参与急性白血病的发生,然而AFF1对实体肿瘤的作用尚无明确的报导。本实验室研究发现,SEC组分AFF1与非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)存在密切联系。结合RNA干扰与与基因表达差异性分析技术,我们在非小细胞肺癌细胞系中敲低AFF1表达水平后发现,CXC趋化因子的转录本含量也随之下调。通过分析转录组测序数据,我们发现在CXC家族中,CXCL1,CXCL3 以及 CXCL5 的 mRNA水平与 AFF1 相关。结合 ChIP-Seq 数据,我们发现AFF1能够结合在编码CXC因子的基因上,染色质免疫共沉淀实验显示,除了 AFF1,SEC的其它组分也结合在CXC家族基因座上。我们认为AFF1对趋化因子家族的调控依赖于SEC复合物的形成。该研究工作揭示了实体肿瘤中AFF1蛋白对趋化因子的调控作用,能够为非小细胞肺癌的治疗提供新的思路。
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