幽门螺杆菌可塑区virB2和virB11基因生物学功能研究

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目的:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是已知与人类胃及十二指肠疾病相关最重要的细菌,virB2和virB11为幽门螺杆菌可塑性区IV型分泌系统tfs3a基因簇结构基因,它们的生物学功能特性在目前可获得的文献中很少报道。为此,本论文以以H.pylori临床分离株H.pylori WH-21可塑性区virB2和virB11基因及其蛋白作为研究对象,通过分子生物学、免疫学和生物信息学进一步研究virB2和virB11基因及其编码产物,为进一步研究H.pylori致病机制及诊断和治疗等奠定基础。方法:1.Karmali培养基微需氧环境中培养H.pylori WH-21菌株。2.PCR法构建virB11基因的原核表达载体,IPTG法诱导宿主表达,Ni2+-NTA法纯化融合蛋白,利用尿素梯度透析复性蛋白免疫家兔制备抗重组VirB11蛋白多克隆抗血清。3.Western blotting法检测VirB11蛋白的亚细胞定位,免疫共沉淀实验和质谱分析方法进行VirB11蛋白的互作蛋白分析。4.将不同浓度的纯化的VirB11蛋白与人正常胃上皮细胞GES-1共培养,并测定共培养后上清液中的IL-8含量。5.合成VirB2蛋白,与正常胃上皮细胞GES-1共培养进行MTT实验,用小鼠制备多克隆抗体,测定抗体效价。6.使用生物信息学软件分析virB2和virB11基因编码蛋白的理化性质、细胞定位、信号肽及空间结构等。结果:1.使用H.pylori WH-21菌株为模板,成功获得了长度为940bp的virB11基因的全长片段。2.通过构建virB11基因的原核表达载体pET28a-virB11,诱导纯化获得VirB11蛋白,免疫雄兔,获得了效价为1:16000的兔抗-VirB11多克隆抗体。3.测定了VirB11蛋白和GES-1共培养的上清液IL-8浓度,结果表明VirB11蛋白的细胞毒性有浓度依赖性,在一定程度上说明宿主炎症的产生与VirB11蛋白的存在有一定的关系。4.通过免疫印迹法、质谱等分析方法,利用免疫雄兔制备的VirB11蛋白的多克隆抗体对VirB11蛋白进行研究的结果表明,VirB11定位于细胞内膜,与ATP合酶β亚基(ATP syntheses subunit beta)、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenate)、胞液氨基肽酶(cytosol aminopeptidase)和F0F1ATP合酶α亚基(F0F1 ATP syntheses subunit alpha)和苹果酸:醌氧化还原酶(malate:quinone oxidoreductase)等存在相互作用。5.利用合成的VirB2蛋白获得了鼠抗-VirB2多克隆抗体,明确了VirB2蛋白是一种有浓度依赖性细胞毒作用的蛋白。6.生物学软件分析显示,virB11基因编码的蛋白质VirB11蛋白的等电点为8.46,VirB11蛋白由313个氨基组成,它的分子量为36kDa,属于亲水性稳定蛋白,空间结构呈六聚体通道状,进一步证实VirB11蛋白参与ATP代谢的功能。virB2基因编码的蛋白质VirB2蛋白的等电点为9.56,VirB2蛋白由313个氨基组成,它的分子量为11kDa,但是它同VirB11蛋白不一样,属于疏水性稳定蛋白。结论:1.通过生物学软件分析,明确了VirB2蛋白是疏水性的稳定蛋白而VirB11蛋白则是一种亲水性的稳定性蛋白。2.明确了VirB11定位于细胞内膜,与ATP合酶β亚基(ATP syntheses subunit beta)、异柠檬酸脱氢酶(isocitrate dehydrogenase)、胞液氨基肽酶(cytosol aminopeptidase)和F0F1ATP合酶α亚基(F0F1 ATP syntheses subunit alpha)和苹果酸:醌氧化还原酶(malate:quinone oxidoreductase)等存在相互作用。进一步证实了VirB11蛋白的ATP代谢相关性。3.明显提示VirB11蛋白与细胞分泌IL-8及组织炎症的发生有关。4.明确了VirB2蛋白的抗原性以及浓度依赖细胞毒的作用。
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