近年来,政府一直倡导进行去行政化改革,但一方面由于缺少细化的政策文件指导,另一方面受行政化问题和“官本位”思想等各方面因素的影响,导致我国公益二类事业单位去行政化改革难以继续推进,其中存在的问题和原因值得我们深入探究。基于此,本文运用了文献研究法、案例分析法、访谈法等研究方法,结合组织变革理论和利益相关者理论,通过梳理相关政策和已有文献,对公益二类事业单位和去行政化的概念进行界定。选取公立高校和公立医院这两种代表类型的公益二类事业单位作为研究对象,通过对A高校和B医院的调研和访谈,从内部组织架构、行政级别现状、人员编制情况、薪酬制度及人才评价机制、福利保障及人才激励体制等多个方面进行分析总结,真实展示了 S市公益二类事业单位去行政化改革的现状及落实情况。在此基础上,提出S市公益二类事业单位去行政化改革推进过程中的问题,主要包括去行政化改革主体责任虚化、改革依据有待完善、改革共识尚未达成,同时在理论指导下对其难以推进的原因进行分析。最后,结合S市去行政化改革实际,探索深化S市公益二类事业单位去行政化改革的对策,推动政事分开,实现政府从“管控”职能到“监管”职能的转变,充分调动公益二类事业单位组织内部的主观能动性和改革意愿,实现法人治理结构的健全和优化。希望能为S市公益二类事业单位去行政化改革和政府制度建设提供一些参考。