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牛乳头状瘤病(papillomaviruses,PV)由牛乳头状瘤病毒(Bovine papillomavirus,BPV)引起的一种发生于体表或粘膜的肿瘤性传染病,以皮肤、粘膜形成乳头状瘤为特征,遍及世界各地牛群,严重的恶性肿瘤病变可导致患畜死亡,给养牛业造成一定的经济损失。本论文研究内容主要有以下三点:1.新疆南疆地区牛乳头瘤病毒的感染调查及分子流行病学研究本次研究在新疆南疆地区进行采样,为了查明新疆南疆地区牛感染BPV的基因型,本研究根据乳头瘤病毒衣壳蛋白L1基因的保守序列设计的简并引物MY11/MY09和特异性引物BAPV1/BAPV2,对新疆南疆地区牛乳头状瘤病料进行了病理组织学检查、PCR检测、免疫组织化学检测,并对新疆南疆地区47份BPV病料进行基因分型。2.新疆南疆地区牛乳头瘤病毒的血清学流行病学调查为了解新疆南疆部分地区牛感染BPV的抗体阳性率,采集552份不同地区不同动物血清利用酶联反应试剂盒对采集的牛乳头瘤病毒血清进行血清血检测,经检测未在血清中发现BPV存在。3.新疆南疆AKS-02株、AKS-03株全基因组的测序、序列及基因组结构分析设计AKS-02株及AKS-03株的基因型特异性扩增引物和测序引物,经测序AKS-02株基因组全长7189bp,包括E6、E7、E1、E8、E2、E5、L2、L1共8个开放阅读框(ORF)。遗传进化树分析显示,AKS-02株为BAPV-3基因型,属于Xi属。AKS-03株基因组全长7966bp,包括E6、E7、E1、E2、E5、E8、L2、L1共8个开放阅读框(ORF)。遗传进化树分析显示,AKS-03株为BPV-14基因型,属于Delta属牛乳头瘤病毒。并对AKS-02株、AKS-03株的全基因组结构进行分析。本次研究对新疆南疆地区牛乳头状瘤病料进行病理组织学检查、PCR检测、免疫组化、及血清学流行病学调查,并对新疆南疆地区BPV毒株进行基因分型鉴定,对已分型的牛乳头瘤病料选取两株做全长基因组测序及结构特征分析,为研究牛乳头瘤的基因分型及序列结构分析提供理论依据。