企业组织是企业管理中一个很重要的内容，本论文的研究首先分析了企业组织面临的形势、发展趋势及其组织诊断的重要性，在此基础上对以往组织诊断所涉及的内容进行总结，对常用的诊断方法进行分析，发现目前的组织诊断中可能存在的缺陷，针对这些缺陷，从众多的方法中筛选出价值工程理论作为诊断的思想和方法。探讨了内部组织功能结构与价值链的关系，找出两者之间的相同之处，进而论证通过功能分析对组织价值链做出诊断的可能性和可行性。在把价值工程作为指导思想和诊断方法下，从功能的角度对企业组织进行诊断，把诊断的对象——组织价值链微观层次划分为部门价值链和业务价值链。然后，本文采用价值工程的分析步骤对内部组织价值链进行分析。分析的过程中注意到将VE的对象从产品扩展到企业组织，分析对象与以往的对象(产品或具体的项目)存在一定的差异，针对这种差异找出改进方法。在功能分析以及组织横向、纵向分析基础上对组织价值链进行优化。本文还选用了典型的实例进行分析，从而证明了这种思路和方法的实用和高效。