新中国成立之初,由于历史原因导致重庆地区高校学生受到多种非马克思主义思想的影响,这些非马克思主义思想毒素形成了该地区高校思想意识形态的困境,阻碍了高校马克思主义意识形态主导地位的构建,影响了全心全意为人民服务、为国家建设服务的高级人才的培养,从而使得高校所培养的人才不能适应伟大的政治变革和经济建设,也不能为国家培养大批的人民教师,这严重阻碍了新民主主义文化教育事业的发展。为了彻底摆脱这些非马克思主义思想所造成的困境,重庆地区高校在党的领导之下设立了多种政治理论课教学机构,以开设政治理论课,对学生实施马克思主义理论教育,借以驱除非马克思主义思想对学生的影响。1949年至1956年七年间,该地区高校政治理论课经过了初创、发展以及课程体系的确立等三个阶段的不断演变与发展,最终形成了以马克思主义理论三大组成部分为核心内容的课程体系,并通过各种方式组建起一支业务水平与思想素质都基本符合政治理论课教学的师资队伍,给予学生系统的马克思主义理论教育。从结果上看,建国初重庆地区高校以政治理论课为主要形式的马克思主义理论教育取得了非常丰硕的成果,其中的某些具体做法与措施对21世纪高校马克思主义理论教育具有重要的借鉴意义和启示。