云南人群β-地中海贫血患者中修饰基因HBG2,BCL11A,HBS1L-MYB和KLF1的遗传变异与血红蛋白Hb F表达水平的相关性研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangtt00
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目的:分析云南人群中HBG2的rs7482144(C>T)位点、BCL11A的rs11886868(C>T)和rs766432(A>C)位点、HBS1L-MYB的rs9399137(T>C)和rs66650371(TAC-3bp)位点以及KLF1基因突变与Hb F水平的相关性;分析云南人群中HBG2的rs7482144位点,BCL11A的rs11886868和rs766432位点,HBS1L-MYB的rs9399137和rs66650371位点以及KLF1基因突变对输血依赖型和非输血依赖型β-地贫患者的临床症状的影响。方法:对4万多名在云南省第一人民医院医学遗传科,进行血红蛋白电泳检测的云南籍人群。收集Hb F高于5%的血样入组,并根据Hb F的值分为不同的组别:5%≤Hb F≤10%组、10%<Hb F≤20%组、Hb F>20%组。根据这些样本数量以1:1选择血红蛋白电泳结果在正常范围以内的血样入对照组。对2万多名地贫基因检测的云南人群,检测结果为β-地贫纯合子(β0/β0)或复合杂合子[β0/β+,β+/β+,(Aγδβ)0]或Hb E/β-地贫(βE/β0,βE/βE)基因型的血样,按照β-地贫的临床症状分为输血依赖型和非输血依赖型。提取上述血样的基因组DNA。对HBG2的rs7482144位点,BCL11A的rs11886868和rs766432位点采用PCR–RFLP方法分析其基因型;对HBS1L-MYB的rs9399137和rs66650371位点采用ARMS分析其基因型;对KLF1基因的c.13G>A,c.41T>C,c.519-525dup CGGCGCC,c.892G>C,c.895C>G,c.913+1G>A,c.1001C>G和c.1022G>A位点采用Sanger测序方法分析其基因型。结果:我们分别对5%≤Hb F≤10%组、10%<Hb F≤20%组、Hb F>20%组的五个SNP位点与Hb F水平进行相关性分析,发现rs7482144位点的P分别为1.69E--14、0.019和0.111;rs11886868位点的P分别为0.205、0.131和0.427;rs766432位点的P分别为2.35E-04、0.053和0.192;rs9399137位点的P分别为1.00E-21、2.05E-06和0.227;rs66650371位点的P分别为1.59E-22、8.47E-08和0.227。对KLF1基因采用Sanger测序发现了3种突变类型,分别是p.F182L(KLF1:T>C)的T/C杂合突变、p.R301C(KLF1:c.901 C>T)的C/T杂合突变和p.R301H(KLF1:c.902 G>A)的G/A杂合突变。我们分别对5%≤Hb F≤10%组、10%<Hb F≤20%组、Hb F>20%组的KLF1突变与Hb F水平进行相关性分析,P分别为0.003、0.005。对上述五个SNP位点的关联性分析发现rs9399137和rs66650371位点连锁不平衡。分别对输血依赖型和非输血依赖型β-地贫患者的五个SNP位点基因型差异性研究,只有非输血依赖型患者rs7482144位点的突变基因型和等位基因的P分别为1.46E-09和5.63E-07。结论:rs7482144、rs9399137、rs66650371与云南β-地贫人群的5%≤Hb F≤20%水平相关,rs766432位点与云南β-地贫人群的5%≤Hb F≤10%水平相关,而rs11886868位点的结果提示该位点与云南β-地贫人群的Hb F水平无关;我们检出云南β-地贫人群的KLF1基因的3种突变类型,分别是c.544 T>C的T/C杂合突变、c.901 C>T的C/T杂合突变和c.902 G>A的G/A杂合突变;且KLF1的这些突变与云南β-地贫人群的5%≤Hb F≤20%水平相关;rs7482144位点的突变基因型和突变等位基因可能减轻β-地贫患者的临床症状。
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